More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2265 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2144  enoyl-CoA hydratase  99.24 
 
 		 263 aa  520  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309295  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2265  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 263 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2251  enoyl-CoA hydratase  94.68 
 
 		 263 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1615  enoyl-CoA hydratase  94.3 
 
 		 263 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2227  enoyl-CoA hydratase  94.3 
 
 		 263 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1050  enoyl-CoA hydratase  91.25 
 
 		 263 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00724493  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5555  enoyl-CoA hydratase  92.4 
 
 		 263 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1086  enoyl-CoA hydratase  83.27 
 
 		 355 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.695016  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1316  enoyl-CoA hydratase  83.27 
 
 		 263 aa  390  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1156  enoyl-CoA hydratase  82.89 
 
 		 263 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0739971  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1803  enoyl-CoA hydratase  82.89 
 
 		 263 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1463  enoyl-CoA hydratase  82.89 
 
 		 263 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0439  enoyl-CoA hydratase  82.89 
 
 		 263 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1325  enoyl-CoA hydratase  82.89 
 
 		 263 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0712  enoyl-CoA hydratase  82.89 
 
 		 263 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.518843  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1370  enoyl-CoA hydratase  75.95 
 
 		 262 aa  380  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57851  hitchhiker  0.00300055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3185  enoyl-CoA hydratase  75.19 
 
 		 262 aa  374  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1984  enoyl-CoA hydratase  75.57 
 
 		 262 aa  374  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0973  enoyl-CoA hydratase  63.74 
 
 		 259 aa  328  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1009  enoyl-CoA hydratase  62.6 
 
 		 259 aa  297  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 		 259 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2014  enoyl-CoA hydratase  61.83 
 
 		 259 aa  292  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.49745  normal  0.0415975 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2169  enoyl-CoA hydratase  60.31 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.086116  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2958  enoyl-CoA hydratase  60.32 
 
 		 259 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1914  enoyl-CoA hydratase  60.7 
 
 		 259 aa  264  8.999999999999999e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.483428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3074  enoyl-CoA hydratase  60.48 
 
 		 259 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.438206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2631  enoyl-CoA hydratase  55.73 
 
 		 259 aa  241  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0399422  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.53 
 
 		 255 aa  230  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.540838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1942  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.63 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2240  enoyl-CoA hydratase  54.07 
 
 		 272 aa  218  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1949  enoyl-CoA hydratase  49.05 
 
 		 257 aa  200  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0840  enoyl-CoA hydratase  48.98 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0193834  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2591  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 		 268 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156463  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4311  enoyl-CoA hydratase  51 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.98 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3735  enoyl-CoA hydratase  48.59 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3016  enoyl-CoA hydratase  48.19 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1397  enoyl-CoA hydratase  46.99 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  35.6 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0581  enoyl-CoA hydratase  34.46 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  37.64 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.75 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 		 262 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 		 260 aa  141  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.5 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.73 
 
 		 255 aa  139  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 		 255 aa  139  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.87 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.78 
 
 		 255 aa  139  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 265 aa  138  8.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 		 267 aa  138  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.78 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5774  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.86 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.78 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 		 266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.63 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  39.59 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.69 
 
 		 258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.76 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.67 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  30.2 
 
 		 261 aa  135  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  34.29 
 
 		 258 aa  135  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  32.44 
 
 		 258 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 		 261 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  36.07 
 
 		 256 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17850  enoyl-CoA hydratase  37.93 
 
 		 265 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.41 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6045  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  37.6 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  39.18 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  35.6 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.96 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229478  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 		 262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.71 
 
 		 263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  31.3 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0388  enoyl-CoA hydratase  34.27 
 
 		 254 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  32.57 
 
 		 254 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.22 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 		 262 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  32.57 
 
 		 254 aa  131  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.79 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.89 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1655  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  36.65 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  35.18 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0655  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.56 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  36.08 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  35.18 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  35.86 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>