More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2591 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2591  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 268 aa  535  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.156463  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0840  enoyl-CoA hydratase  72.31 
 
 		 273 aa  332  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0193834  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3016  enoyl-CoA hydratase  64.34 
 
 		 274 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1397  enoyl-CoA hydratase  64.48 
 
 		 266 aa  280  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3735  enoyl-CoA hydratase  63.95 
 
 		 276 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4311  enoyl-CoA hydratase  65.77 
 
 		 269 aa  276  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2240  enoyl-CoA hydratase  50.39 
 
 		 272 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  41.86 
 
 		 259 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2169  enoyl-CoA hydratase  41.86 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.086116  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0973  enoyl-CoA hydratase  40.31 
 
 		 259 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1370  enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57851  hitchhiker  0.00300055 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1050  enoyl-CoA hydratase  46.31 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00724493  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2144  enoyl-CoA hydratase  47.13 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309295  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1984  enoyl-CoA hydratase  46.31 
 
 		 262 aa  181  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2265  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2958  enoyl-CoA hydratase  43.02 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1086  enoyl-CoA hydratase  46.31 
 
 		 355 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.695016  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2014  enoyl-CoA hydratase  42.25 
 
 		 259 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.49745  normal  0.0415975 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1316  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3185  enoyl-CoA hydratase  43.3 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1803  enoyl-CoA hydratase  46.31 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0439  enoyl-CoA hydratase  46.31 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1463  enoyl-CoA hydratase  46.31 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1156  enoyl-CoA hydratase  46.31 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0739971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1325  enoyl-CoA hydratase  46.31 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0712  enoyl-CoA hydratase  46.31 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.518843  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.96 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.540838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2251  enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 		 263 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3074  enoyl-CoA hydratase  47.49 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.438206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1615  enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2227  enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1942  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.96 
 
 		 255 aa  170  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5555  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2631  enoyl-CoA hydratase  41.86 
 
 		 259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0399422  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1009  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 		 257 aa  158  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.54 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1914  enoyl-CoA hydratase  41.09 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.483428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6846  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.13 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4594  enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 		 273 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.97 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1655  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.64 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  31.1 
 
 		 261 aa  142  8e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  39 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.12 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal  0.988887 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  35.52 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.85 
 
 		 262 aa  139  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  38.17 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.34 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 		 265 aa  138  8.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 		 284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  34.73 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 		 276 aa  136  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 		 267 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.96 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1594  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 		 263 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  38.13 
 
 		 263 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 		 265 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 		 267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  34.45 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4185  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 		 260 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.75 
 
 		 259 aa  132  6.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.95 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  32.55 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.94 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>