More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0655 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0655  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
261 aa  527  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  58.04 
 
 
257 aa  278  7e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  54.18 
 
 
255 aa  264  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.18 
 
 
255 aa  263  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  54.18 
 
 
255 aa  263  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  54.18 
 
 
255 aa  263  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  48.85 
 
 
275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2475  enoyl-CoA hydratase-isomerase  51.22 
 
 
257 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.932872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2612  enoyl-CoA hydratase-isomerase  51.63 
 
 
257 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40881  normal  0.0709716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3284  enoyl-CoA hydratase-isomerase  50.81 
 
 
257 aa  224  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34821  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2625  enoyl-CoA hydratase-isomerase  50.81 
 
 
257 aa  224  9e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.83 
 
 
259 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  43.67 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  43.27 
 
 
257 aa  211  7e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  42.04 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  41.41 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.71 
 
 
258 aa  198  9e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.89 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  42.28 
 
 
258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  41.3 
 
 
259 aa  195  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.26 
 
 
258 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  43.44 
 
 
253 aa  192  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  41.7 
 
 
257 aa  192  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  39.76 
 
 
262 aa  191  9e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.26 
 
 
258 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 
258 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  42.39 
 
 
261 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 
262 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3644  enoyl-CoA hydratase  41.98 
 
 
261 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  40.89 
 
 
283 aa  187  2e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  40.65 
 
 
257 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  41.74 
 
 
258 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  40.33 
 
 
258 aa  185  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  40.96 
 
 
258 aa  185  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.49 
 
 
258 aa  185  8e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.25 
 
 
263 aa  184  9e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.36 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1795  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.21 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  40.5 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  38.19 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  40.89 
 
 
257 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229478  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 
258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 
259 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
277 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.83 
 
 
258 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.61 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  39.27 
 
 
259 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
260 aa  178  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  38.71 
 
 
258 aa  178  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
258 aa  178  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 
258 aa  178  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.34 
 
 
265 aa  178  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.57 
 
 
266 aa  178  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000608326  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.65 
 
 
259 aa  178  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 
259 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
256 aa  177  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.49 
 
 
257 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0382  short chain enoyl-CoA hydratase  39.59 
 
 
257 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.123728  hitchhiker  0.00785699 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 
259 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  39.52 
 
 
258 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  39.3 
 
 
260 aa  177  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  39.43 
 
 
251 aa  177  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.5 
 
 
256 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.62 
 
 
258 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  38.86 
 
 
257 aa  176  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0176  short chain enoyl-CoA hydratase  39.18 
 
 
257 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.212196  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  37.9 
 
 
258 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  41.56 
 
 
262 aa  176  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.11 
 
 
259 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.89 
 
 
259 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 
260 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  39.83 
 
 
258 aa  175  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.61 
 
 
256 aa  176  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.32 
 
 
257 aa  175  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
259 aa  175  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.32 
 
 
262 aa  175  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
257 aa  174  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.61 
 
 
261 aa  175  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.68 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.73 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  37.75 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.86 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 
259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  38.86 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.08 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.71 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.06 
 
 
265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05916  enoyl-CoA hydratase (Eurofung)  38.98 
 
 
289 aa  172  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295699  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  40.17 
 
 
258 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  40.96 
 
 
258 aa  171  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.06 
 
 
265 aa  171  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.76 
 
 
258 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 
258 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  39.04 
 
 
258 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.19 
 
 
266 aa  171  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
257 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  39.3 
 
 
257 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  39.3 
 
 
257 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>