More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1259 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1259  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 250 aa  489  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4141  enoyl-CoA hydratase  56.8 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18010  Enoyl-CoA hydratase  52.21 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.671643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 		 263 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.59 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  41.77 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  36.55 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  37.55 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  38.27 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.06 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  38.74 
 
 		 263 aa  151  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.36 
 
 		 267 aa  151  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  36.76 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0895  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.89 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  37.04 
 
 		 262 aa  148  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  39.09 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.37 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.25 
 
 		 262 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3344  enoyl-CoA hydratase  39.83 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.875578  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  32.79 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  39.43 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  38.21 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3395  enoyl-CoA hydratase  39.83 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3333  enoyl-CoA hydratase  39.83 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0320985  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1007  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.11 
 
 		 276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57099  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.98 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 		 261 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  38.75 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.89 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.98 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4068  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.09 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  34.14 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 		 260 aa  142  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.2 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.51 
 
 		 264 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  38.11 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0026  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.17 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  35.08 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 		 264 aa  139  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.1 
 
 		 263 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  39.64 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  39.64 
 
 		 262 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  39.64 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4089  enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  39.64 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6738  enoyl-CoA hydratase  40.32 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3203  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.78 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  39.67 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  39.81 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.57 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 		 264 aa  134  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.1 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0814  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.44 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134124  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.69 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.17 
 
 		 264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.61 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  38.11 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0278  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  40.91 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.82 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  38.84 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 		 262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  38.84 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  40.49 
 
 		 276 aa  131  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0809  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.044471  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  38.84 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.84 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000721466  hitchhiker  0.00000000959721 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  38.15 
 
 		 263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3582  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000838255  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0777  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160248  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  38.59 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  39.17 
 
 		 263 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.76 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  40.09 
 
 		 266 aa  128  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4886  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.74 
 
 		 269 aa  128  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  34.9 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>