More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18010 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_18010  Enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 251 aa  496  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.671643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1259  enoyl-CoA hydratase  52.21 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4141  enoyl-CoA hydratase  54.58 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.84 
 
 		 261 aa  150  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1007  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.72 
 
 		 276 aa  148  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57099  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  42.27 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  39.17 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  40.55 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4068  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.92 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  34.68 
 
 		 262 aa  135  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4089  enoyl-CoA hydratase  43 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.5 
 
 		 261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  35.68 
 
 		 262 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0026  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.42 
 
 		 262 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0278  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  42.79 
 
 		 262 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 		 263 aa  129  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  34.62 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  34.44 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.44 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0222  enoyl-CoA hydratase  38.76 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2354  enoyl-CoA hydratase  37.66 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239934  normal  0.727951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.78 
 
 		 271 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.76 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  34.31 
 
 		 259 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.36 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  39.81 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.61 
 
 		 264 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2031  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.14 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.44 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0540  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.85 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0616524  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  37.32 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  38.19 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  38.18 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.13 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.77 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  38.5 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.53 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.04 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.91 
 
 		 264 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1836  enoyl-CoA hydratase  40.28 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.395714  normal  0.321075 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3732  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.407726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.28 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2169  enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.086116  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.77 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  34.21 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 		 271 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0228  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.73 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2014  enoyl-CoA hydratase  34.31 
 
 		 259 aa  122  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.49745  normal  0.0415975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3600  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.465464 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0814  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.49 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134124  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  42.23 
 
 		 283 aa  121  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.6 
 
 		 246 aa  121  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0702  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.71 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6738  enoyl-CoA hydratase  39.63 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4579  enoyl-CoA hydratase  39.52 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781565  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.28 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.13 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.25 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  38.6 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 		 273 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  36.32 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  33.48 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  37.25 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.96 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.91 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.81 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3344  enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.875578  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  36 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3333  enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0320985  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3395  enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  33.48 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  33.04 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.36 
 
 		 261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0973  enoyl-CoA hydratase  37.02 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0850913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.73 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3203  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.55 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  33.63 
 
 		 264 aa  118  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  37.14 
 
 		 268 aa  119  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2174  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.56 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.262533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1575  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.53 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00524815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  38.14 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0407  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.18 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2517  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.81 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.49 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.56 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.45 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  39.9 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>