More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2031 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2031  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 248 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3732  enoyl-CoA hydratase/isomerase  99.19 
 
 		 248 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.407726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2174  enoyl-CoA hydratase/isomerase  94.33 
 
 		 248 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.262533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4449  enoyl-CoA hydratase  51.82 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3262  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.96 
 
 		 257 aa  208  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  46.31 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  46.31 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56250  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.42 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.31 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0476  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4899  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.68 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0389  enoyl-CoA hydratase  41.7 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593018 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4029  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.03 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0388  enoyl-CoA hydratase  40.57 
 
 		 254 aa  185  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4083  enoyl-CoA hydratase  43.09 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4035  enoyl-CoA hydratase  41.87 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0577  enoyl-CoA hydratase  41.77 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0598  enoyl-CoA hydratase  41.77 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0450  enoyl-CoA hydratase  38.74 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0581  enoyl-CoA hydratase  41.8 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0414  enoyl-CoA hydratase  44.08 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0435111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.15 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.58 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000610826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3240  enoyl-CoA hydratase  37.39 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596711  hitchhiker  0.0000100182 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0664  enoyl-CoA hydratase  41.87 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556097  normal  0.974332 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.97 
 
 		 245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000721466  hitchhiker  0.00000000959721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0777  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.97 
 
 		 245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3582  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.97 
 
 		 245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000838255  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0809  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.97 
 
 		 245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.044471  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0540  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.66 
 
 		 245 aa  164  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0616524  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0820  enoyl-CoA hydratase  41.7 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3908  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.39 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3932  enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0749  enoyl-CoA hydratase  36.97 
 
 		 245 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.102863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0721  enoyl-CoA hydratase  36.97 
 
 		 245 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000678732  hitchhiker  0.00168791 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4199  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.55 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0335602  hitchhiker  0.000324097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6045  enoyl-CoA hydratase  40.98 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0764  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.13 
 
 		 245 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1575  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.89 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00524815 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3229  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.51 
 
 		 245 aa  158  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547446  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2718  enoyl-CoA hydratase  40.98 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.189949  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2745  enoyl-CoA hydratase  40.98 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0301258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2106  enoyl-CoA hydratase  40.73 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1343  enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.08 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1899  enoyl-CoA hydratase  40.24 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4754  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.43 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3473  enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0427069  normal  0.591102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.28 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4526  enoyl-CoA hydratase  36.63 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3326  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.91 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0855864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0673  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.1 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0684  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.17 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1748  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.03 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.828974  normal  0.0355231 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2636  enoyl-CoA hydratase  40.57 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3336  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.39 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.212368  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2770  enoyl-CoA hydratase  40.57 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0683  enoyl-CoA hydratase  43.04 
 
 		 280 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0200  enoyl-CoA hydratase  43.04 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.627685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2333  enoyl-CoA hydratase  43.04 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1086  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.78 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0860  enoyl-CoA hydratase  43.04 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2413  enoyl-CoA hydratase  43.04 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.921816  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2745  enoyl-CoA hydratase  43.04 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0698  enoyl-CoA hydratase  43.04 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3512  enoyl-CoA hydratase  37.65 
 
 		 254 aa  144  9e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2587  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.33 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000356951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0567  enoyl-CoA hydratase  42.62 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.234346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02193  enoyl-CoA hydratase  33.87 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.114495  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0601  enoyl-CoA hydratase  36.56 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.456666  normal  0.324394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2861  enoyl-CoA hydratase  39.11 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.742849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.27 
 
 		 255 aa  138  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4299  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5771  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0488  enoyl-CoA hydratase  36.91 
 
 		 250 aa  135  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2371  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.75 
 
 		 254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2485  enoyl-CoA hydratase  35.59 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1027  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.19 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2745  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.78 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0562194  normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 		 259 aa  131  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287025  decreased coverage  0.00358317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3630  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 		 259 aa  131  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3325  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.22 
 
 		 250 aa  129  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 		 260 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.44 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.768102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2790  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.77 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.593041  normal  0.157117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1056  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.73 
 
 		 245 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2804  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 		 252 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0776808  normal  0.568197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2760  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 		 252 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85821  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.92 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  35.59 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2378  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.0124738 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.87 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.35 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.45 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>