More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0664 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0664  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
256 aa  513  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556097  normal  0.974332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4035  enoyl-CoA hydratase  94.92 
 
 
256 aa  471  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0388  enoyl-CoA hydratase  81.82 
 
 
254 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0581  enoyl-CoA hydratase  74.22 
 
 
256 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  65.75 
 
 
254 aa  345  5e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6045  enoyl-CoA hydratase  73.91 
 
 
255 aa  344  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  65.35 
 
 
254 aa  344  7e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0476  enoyl-CoA hydratase  66.4 
 
 
254 aa  341  7e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0683  enoyl-CoA hydratase  74.41 
 
 
280 aa  341  7e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0200  enoyl-CoA hydratase  74.41 
 
 
254 aa  341  8e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.627685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2333  enoyl-CoA hydratase  74.41 
 
 
254 aa  341  8e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0860  enoyl-CoA hydratase  74.41 
 
 
280 aa  341  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2413  enoyl-CoA hydratase  74.41 
 
 
280 aa  341  8e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.921816  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2745  enoyl-CoA hydratase  74.41 
 
 
280 aa  341  8e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0567  enoyl-CoA hydratase  74.02 
 
 
259 aa  340  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2745  enoyl-CoA hydratase  74.31 
 
 
255 aa  338  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0301258  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2718  enoyl-CoA hydratase  74.31 
 
 
255 aa  338  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.189949  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0698  enoyl-CoA hydratase  74.02 
 
 
280 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2106  enoyl-CoA hydratase  73.91 
 
 
255 aa  334  7e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2770  enoyl-CoA hydratase  73.52 
 
 
255 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2636  enoyl-CoA hydratase  73.52 
 
 
255 aa  328  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0389  enoyl-CoA hydratase  65.76 
 
 
258 aa  326  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00593018 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0450  enoyl-CoA hydratase  63.81 
 
 
258 aa  321  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1343  enoyl-CoA hydratase  58.69 
 
 
264 aa  291  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0577  enoyl-CoA hydratase  57.43 
 
 
258 aa  285  7e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0598  enoyl-CoA hydratase  57.43 
 
 
258 aa  285  7e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3932  enoyl-CoA hydratase  58.96 
 
 
274 aa  281  8.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4083  enoyl-CoA hydratase  57.77 
 
 
257 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543803  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0820  enoyl-CoA hydratase  58.96 
 
 
254 aa  279  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1899  enoyl-CoA hydratase  59.04 
 
 
258 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3473  enoyl-CoA hydratase  58.23 
 
 
261 aa  268  7e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0427069  normal  0.591102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.06 
 
 
261 aa  265  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0414  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 
256 aa  256  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0435111  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3512  enoyl-CoA hydratase  56.18 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4029  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.17 
 
 
254 aa  241  7e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3908  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  47.33 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3240  enoyl-CoA hydratase  47.33 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596711  hitchhiker  0.0000100182 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0749  enoyl-CoA hydratase  47.33 
 
 
245 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.102863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0721  enoyl-CoA hydratase  47.33 
 
 
245 aa  233  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000678732  hitchhiker  0.00168791 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 
245 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000721466  hitchhiker  0.00000000959721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0809  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 
245 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.044471  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0777  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 
245 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3582  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 
245 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000838255  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0764  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.86 
 
 
245 aa  227  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.98 
 
 
262 aa  220  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0540  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.67 
 
 
245 aa  218  7e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0616524  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  45.27 
 
 
246 aa  217  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.84 
 
 
258 aa  216  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0855864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2378  enoyl-CoA hydratase  48.43 
 
 
257 aa  215  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.0124738 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.9 
 
 
246 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000610826 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3229  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.62 
 
 
245 aa  211  7e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547446  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4199  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.62 
 
 
245 aa  211  9e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0335602  hitchhiker  0.000324097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3262  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.05 
 
 
257 aa  210  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3336  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.91 
 
 
245 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.212368  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.63 
 
 
279 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56250  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.09 
 
 
257 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02193  enoyl-CoA hydratase  43.82 
 
 
254 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.114495  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.27 
 
 
245 aa  206  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.87 
 
 
264 aa  206  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1027  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.11 
 
 
264 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.27 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4526  enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 
258 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3326  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3630  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.88 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.88 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287025  decreased coverage  0.00358317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2485  enoyl-CoA hydratase  41.9 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4449  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 
249 aa  195  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4899  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.88 
 
 
257 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0601  enoyl-CoA hydratase  46.84 
 
 
251 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.456666  normal  0.324394 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.9 
 
 
253 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.234346  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0527  enoyl-CoA hydratase  43.2 
 
 
249 aa  191  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.850744  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4299  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0684  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.14 
 
 
256 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0411  enoyl-CoA hydratase  41.43 
 
 
250 aa  185  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.477081  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1575  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.66 
 
 
250 aa  184  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00524815 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0419  enoyl-CoA hydratase  41.43 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.54 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2031  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.87 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3732  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.63 
 
 
248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.407726  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2745  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.31 
 
 
258 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0562194  normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0987  enoyl-CoA hydratase  45.15 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2174  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.41 
 
 
248 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.262533  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0488  enoyl-CoA hydratase  44.07 
 
 
250 aa  178  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308254  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2371  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.63 
 
 
254 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.53 
 
 
260 aa  175  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.768102 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4754  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.5 
 
 
242 aa  175  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0673  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.52 
 
 
241 aa  172  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0556  enoyl-CoA hydratase  46.84 
 
 
251 aa  171  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5771  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.55 
 
 
258 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2861  enoyl-CoA hydratase  46.7 
 
 
257 aa  169  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.742849  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1748  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 
260 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.828974  normal  0.0355231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1056  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.09 
 
 
245 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1086  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 
257 aa  161  9e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2840  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.24 
 
 
252 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.339924  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2790  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 
252 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.490827  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2804  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 
252 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0776808  normal  0.568197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2760  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 
252 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85821  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4289  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.76 
 
 
254 aa  149  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186398  normal  0.756398 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
266 aa  146  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
259 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0835  enoyl-CoA hydratase  42.51 
 
 
220 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0159384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>