More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4707 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 259 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287025  decreased coverage  0.00358317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3630  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 259 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5771  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.55 
 
 		 258 aa  308  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2745  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61 
 
 		 258 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0562194  normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0684  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.31 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4526  enoyl-CoA hydratase  56.37 
 
 		 258 aa  292  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3326  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0450  enoyl-CoA hydratase  49.41 
 
 		 258 aa  235  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1343  enoyl-CoA hydratase  51.21 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0389  enoyl-CoA hydratase  49.39 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593018 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0577  enoyl-CoA hydratase  49.02 
 
 		 258 aa  225  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0598  enoyl-CoA hydratase  49.8 
 
 		 258 aa  225  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0820  enoyl-CoA hydratase  52.51 
 
 		 254 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4083  enoyl-CoA hydratase  51.75 
 
 		 257 aa  221  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3932  enoyl-CoA hydratase  51.59 
 
 		 274 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1899  enoyl-CoA hydratase  51.95 
 
 		 258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0476  enoyl-CoA hydratase  48.62 
 
 		 254 aa  209  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0414  enoyl-CoA hydratase  52.53 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0435111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.31 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0540  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.94 
 
 		 245 aa  205  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0616524  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0388  enoyl-CoA hydratase  47.54 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  45.45 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3473  enoyl-CoA hydratase  48.41 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0427069  normal  0.591102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  45.06 
 
 		 254 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4029  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.04 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3512  enoyl-CoA hydratase  48.78 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4035  enoyl-CoA hydratase  46.88 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.23 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2485  enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.13 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3262  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.21 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1575  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.22 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00524815 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0581  enoyl-CoA hydratase  45.31 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0664  enoyl-CoA hydratase  46.88 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556097  normal  0.974332 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4199  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 		 245 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0335602  hitchhiker  0.000324097 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0527  enoyl-CoA hydratase  42.63 
 
 		 249 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.850744  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1027  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 		 264 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6045  enoyl-CoA hydratase  45.45 
 
 		 255 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 		 253 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.234346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.89 
 
 		 246 aa  178  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000610826 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02193  enoyl-CoA hydratase  38.15 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.114495  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3229  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.89 
 
 		 245 aa  178  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547446  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2745  enoyl-CoA hydratase  45.31 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0301258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4299  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.65 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3240  enoyl-CoA hydratase  40.49 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596711  hitchhiker  0.0000100182 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.4 
 
 		 258 aa  178  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0855864 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2718  enoyl-CoA hydratase  45.31 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.189949  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.74 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56250  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.83 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0721  enoyl-CoA hydratase  40.49 
 
 		 245 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000678732  hitchhiker  0.00168791 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0749  enoyl-CoA hydratase  40.49 
 
 		 245 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.102863 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3582  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 		 245 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000838255  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 		 245 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000721466  hitchhiker  0.00000000959721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0777  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 		 245 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0809  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.68 
 
 		 245 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.044471  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3908  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.49 
 
 		 245 aa  174  9e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0764  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.87 
 
 		 245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0987  enoyl-CoA hydratase  44.17 
 
 		 252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2106  enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2371  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.53 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0601  enoyl-CoA hydratase  42.5 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.456666  normal  0.324394 
 
 
-
 
NC_004310  BR0411  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 		 250 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.477081  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0419  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2636  enoyl-CoA hydratase  44.66 
 
 		 255 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2770  enoyl-CoA hydratase  44.27 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0488  enoyl-CoA hydratase  42.08 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4899  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.3 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.06 
 
 		 245 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0567  enoyl-CoA hydratase  47.22 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.53 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.768102 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3336  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.89 
 
 		 245 aa  158  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.212368  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0200  enoyl-CoA hydratase  47.22 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.627685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0860  enoyl-CoA hydratase  47.22 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0683  enoyl-CoA hydratase  47.22 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0698  enoyl-CoA hydratase  47.22 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2413  enoyl-CoA hydratase  47.22 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.921816  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2745  enoyl-CoA hydratase  47.22 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2333  enoyl-CoA hydratase  47.22 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4449  enoyl-CoA hydratase  41.18 
 
 		 249 aa  155  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2840  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.85 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.339924  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0673  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.27 
 
 		 241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4754  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  36.48 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2587  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.57 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000356951  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2861  enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 		 257 aa  145  9e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.742849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.73 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0556  enoyl-CoA hydratase  40.83 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  33.05 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1086  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 		 257 aa  135  9e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2378  enoyl-CoA hydratase  38.37 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.0124738 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3732  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.407726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1056  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.82 
 
 		 245 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2031  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2174  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.262533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.6 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2804  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.71 
 
 		 252 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0776808  normal  0.568197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>