More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1086 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1086  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
257 aa  527  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.76 
 
 
261 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2587  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.4 
 
 
255 aa  175  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000356951  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.79 
 
 
262 aa  172  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0388  enoyl-CoA hydratase  39.09 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0389  enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 
258 aa  165  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00593018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.52 
 
 
253 aa  166  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3325  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.84 
 
 
250 aa  164  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4035  enoyl-CoA hydratase  38.43 
 
 
256 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0476  enoyl-CoA hydratase  37.3 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1343  enoyl-CoA hydratase  36.74 
 
 
264 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0340  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.53 
 
 
254 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.486328  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
254 aa  158  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.66 
 
 
252 aa  158  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.593041  normal  0.157117 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
254 aa  158  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0450  enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
258 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2804  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.59 
 
 
252 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0776808  normal  0.568197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2760  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.59 
 
 
252 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85821  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2790  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.59 
 
 
252 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.490827  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0577  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
258 aa  156  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0598  enoyl-CoA hydratase  36.29 
 
 
258 aa  155  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.2 
 
 
246 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0664  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556097  normal  0.974332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56250  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4526  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
258 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3326  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3932  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
274 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3262  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 
257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0581  enoyl-CoA hydratase  37.9 
 
 
256 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3732  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.78 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.407726  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1575  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.06 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00524815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2031  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.78 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4029  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
254 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6045  enoyl-CoA hydratase  39.11 
 
 
255 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1899  enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 
258 aa  145  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1056  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.68 
 
 
245 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0820  enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 
254 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.3 
 
 
260 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.768102 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4899  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.11 
 
 
257 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  34.87 
 
 
262 aa  142  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2174  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.33 
 
 
248 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.262533  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3512  enoyl-CoA hydratase  38.49 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2745  enoyl-CoA hydratase  37.9 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0301258  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2718  enoyl-CoA hydratase  37.9 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.189949  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 
260 aa  138  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4083  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
257 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543803  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3473  enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 
261 aa  138  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0427069  normal  0.591102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0684  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 
256 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  35.25 
 
 
263 aa  137  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2106  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
255 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3908  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.12 
 
 
245 aa  136  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
263 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0200  enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.627685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2333  enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2636  enoyl-CoA hydratase  37.9 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2770  enoyl-CoA hydratase  37.9 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287025  decreased coverage  0.00358317 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2745  enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0414  enoyl-CoA hydratase  38.19 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0435111  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0860  enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3630  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.41 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0683  enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0567  enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 
259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  32.32 
 
 
262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1748  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.78 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.828974  normal  0.0355231 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2413  enoyl-CoA hydratase  38.93 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.921816  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3240  enoyl-CoA hydratase  30.29 
 
 
245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596711  hitchhiker  0.0000100182 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.1 
 
 
266 aa  133  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0749  enoyl-CoA hydratase  30.29 
 
 
245 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.102863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0721  enoyl-CoA hydratase  30.29 
 
 
245 aa  132  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000678732  hitchhiker  0.00168791 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2745  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.43 
 
 
258 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0562194  normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0698  enoyl-CoA hydratase  39.42 
 
 
280 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.74 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4449  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  32.3 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0540  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.16 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0616524  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5771  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
258 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0764  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.63 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3582  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.05 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000838255  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0809  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.05 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.044471  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0777  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.05 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.05 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000721466  hitchhiker  0.00000000959721 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.07 
 
 
246 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000610826 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.72 
 
 
263 aa  128  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0527  enoyl-CoA hydratase  32.8 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.850744  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
261 aa  125  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.5 
 
 
255 aa  125  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  31.5 
 
 
255 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  31.5 
 
 
255 aa  125  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  32.78 
 
 
257 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.42 
 
 
264 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  31.5 
 
 
255 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0673  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.5 
 
 
241 aa  123  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 
268 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  31.27 
 
 
262 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_004310  BR0411  enoyl-CoA hydratase  31.87 
 
 
250 aa  123  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.477081  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  32.05 
 
 
263 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
263 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>