More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5771 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5771  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 258 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4526  enoyl-CoA hydratase  69.77 
 
 		 258 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3326  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2745  enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.05 
 
 		 258 aa  352  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0562194  normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3630  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.55 
 
 		 259 aa  311  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.55 
 
 		 259 aa  311  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287025  decreased coverage  0.00358317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0684  enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.22 
 
 		 256 aa  295  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1343  enoyl-CoA hydratase  46.43 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0476  enoyl-CoA hydratase  49 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0450  enoyl-CoA hydratase  44.53 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3932  enoyl-CoA hydratase  48.06 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0577  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 		 258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0598  enoyl-CoA hydratase  46.77 
 
 		 258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0820  enoyl-CoA hydratase  49.4 
 
 		 254 aa  211  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1899  enoyl-CoA hydratase  49.19 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.36 
 
 		 262 aa  208  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  45.97 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  45.56 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4029  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.88 
 
 		 254 aa  205  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.49 
 
 		 279 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4083  enoyl-CoA hydratase  47.24 
 
 		 257 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3473  enoyl-CoA hydratase  47.08 
 
 		 261 aa  201  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0427069  normal  0.591102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0389  enoyl-CoA hydratase  44.19 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00593018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.31 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.58 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3512  enoyl-CoA hydratase  47.37 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.98 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02193  enoyl-CoA hydratase  42.32 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.114495  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0414  enoyl-CoA hydratase  48.8 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0435111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0540  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.8 
 
 		 245 aa  191  9e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0616524  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0388  enoyl-CoA hydratase  42.41 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0581  enoyl-CoA hydratase  45.95 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4199  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.8 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0335602  hitchhiker  0.000324097 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1575  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00524815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3262  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.18 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1027  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.09 
 
 		 264 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.74 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.234346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4299  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.93 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4035  enoyl-CoA hydratase  44.35 
 
 		 256 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.8 
 
 		 246 aa  178  9e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000610826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.12 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0855864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2485  enoyl-CoA hydratase  39.5 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56250  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.02 
 
 		 257 aa  175  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6045  enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.33 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3229  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 		 245 aa  172  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547446  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3240  enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596711  hitchhiker  0.0000100182 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3908  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.55 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0721  enoyl-CoA hydratase  38.15 
 
 		 245 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000678732  hitchhiker  0.00168791 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0777  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160248  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0673  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.97 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000721466  hitchhiker  0.00000000959721 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2718  enoyl-CoA hydratase  43.19 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.189949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0809  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.044471  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3582  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.15 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000838255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2745  enoyl-CoA hydratase  43.19 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0301258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0749  enoyl-CoA hydratase  38.15 
 
 		 245 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.102863 
 
 
-
 
NC_004310  BR0411  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.477081  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0764  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.75 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0419  enoyl-CoA hydratase  39.92 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0527  enoyl-CoA hydratase  40.34 
 
 		 249 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.850744  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4754  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.34 
 
 		 242 aa  165  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 		 260 aa  164  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.768102 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0664  enoyl-CoA hydratase  43.55 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556097  normal  0.974332 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2106  enoyl-CoA hydratase  42.8 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2371  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.03 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0200  enoyl-CoA hydratase  45.31 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.627685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0683  enoyl-CoA hydratase  45.97 
 
 		 280 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2745  enoyl-CoA hydratase  45.97 
 
 		 280 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2413  enoyl-CoA hydratase  45.97 
 
 		 280 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.921816  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0860  enoyl-CoA hydratase  45.97 
 
 		 280 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2333  enoyl-CoA hydratase  45.31 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0698  enoyl-CoA hydratase  46.53 
 
 		 280 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2636  enoyl-CoA hydratase  44.14 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3336  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 		 245 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.212368  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2587  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000356951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4899  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.46 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2770  enoyl-CoA hydratase  44.53 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4449  enoyl-CoA hydratase  41.08 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0567  enoyl-CoA hydratase  45.31 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0987  enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0601  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.456666  normal  0.324394 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2861  enoyl-CoA hydratase  38.04 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.742849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.98 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2840  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.57 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.339924  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  35.43 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0488  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.79 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  34.73 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 		 263 aa  140  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.41 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1056  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.19 
 
 		 245 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.06 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3732  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.57 
 
 		 248 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.407726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2031  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.57 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1747  enoyl-CoA hydratase  33.99 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1813  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1766  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>