More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4449 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4449  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
249 aa  501  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3262  enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.55 
 
 
257 aa  321  7e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56250  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.52 
 
 
257 aa  292  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4899  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.52 
 
 
257 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4029  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.12 
 
 
254 aa  249  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3732  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.82 
 
 
248 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.407726  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2031  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.82 
 
 
248 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2174  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.42 
 
 
248 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.262533  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.58 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0389  enoyl-CoA hydratase  45.49 
 
 
258 aa  222  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00593018 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0540  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.72 
 
 
245 aa  219  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0616524  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0450  enoyl-CoA hydratase  45.12 
 
 
258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.67 
 
 
246 aa  215  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000610826 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4199  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.15 
 
 
245 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0335602  hitchhiker  0.000324097 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4035  enoyl-CoA hydratase  47.13 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0577  enoyl-CoA hydratase  45.34 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0598  enoyl-CoA hydratase  45.34 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3932  enoyl-CoA hydratase  47.18 
 
 
274 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1343  enoyl-CoA hydratase  46.22 
 
 
264 aa  209  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0388  enoyl-CoA hydratase  45.34 
 
 
254 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4083  enoyl-CoA hydratase  46.56 
 
 
257 aa  208  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543803  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  45.42 
 
 
254 aa  208  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  45.42 
 
 
254 aa  207  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3240  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
245 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596711  hitchhiker  0.0000100182 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0809  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 
245 aa  205  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.044471  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 
245 aa  205  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000721466  hitchhiker  0.00000000959721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0777  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 
245 aa  205  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3582  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.03 
 
 
245 aa  205  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000838255  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0749  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
245 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.102863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0721  enoyl-CoA hydratase  42.91 
 
 
245 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000678732  hitchhiker  0.00168791 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3908  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  43.03 
 
 
245 aa  202  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0581  enoyl-CoA hydratase  44.67 
 
 
256 aa  201  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0764  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.21 
 
 
245 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0476  enoyl-CoA hydratase  44.96 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  45.56 
 
 
246 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0414  enoyl-CoA hydratase  48.36 
 
 
256 aa  198  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0435111  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0820  enoyl-CoA hydratase  45.75 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3473  enoyl-CoA hydratase  43.32 
 
 
261 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0427069  normal  0.591102 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.75 
 
 
245 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0664  enoyl-CoA hydratase  46.72 
 
 
256 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556097  normal  0.974332 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.42 
 
 
258 aa  192  6e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0855864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6045  enoyl-CoA hydratase  42.62 
 
 
255 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3229  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.7 
 
 
245 aa  190  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547446  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.09 
 
 
262 aa  189  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 
264 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02193  enoyl-CoA hydratase  42.11 
 
 
254 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.114495  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1899  enoyl-CoA hydratase  44.67 
 
 
258 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1575  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.09 
 
 
250 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00524815 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0684  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.2 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2745  enoyl-CoA hydratase  42.62 
 
 
255 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0301258  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2106  enoyl-CoA hydratase  43.44 
 
 
255 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2718  enoyl-CoA hydratase  42.62 
 
 
255 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.189949  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0411  enoyl-CoA hydratase  41.9 
 
 
250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.477081  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0419  enoyl-CoA hydratase  41.9 
 
 
250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 
253 aa  182  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0601  enoyl-CoA hydratase  42.73 
 
 
251 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.456666  normal  0.324394 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0673  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  40.82 
 
 
241 aa  180  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3512  enoyl-CoA hydratase  43.72 
 
 
254 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2485  enoyl-CoA hydratase  38.49 
 
 
253 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1027  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
264 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4754  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  42.8 
 
 
242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2770  enoyl-CoA hydratase  44.26 
 
 
255 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2636  enoyl-CoA hydratase  44.26 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2861  enoyl-CoA hydratase  43.35 
 
 
257 aa  178  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.742849  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0527  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
249 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.850744  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4299  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 
253 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3336  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.51 
 
 
245 aa  175  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.212368  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4526  enoyl-CoA hydratase  40.8 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3326  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.234346  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5771  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1056  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.22 
 
 
245 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2371  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.62 
 
 
254 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2378  enoyl-CoA hydratase  43.78 
 
 
257 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.0124738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2745  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.35 
 
 
258 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0562194  normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.8 
 
 
279 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0200  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 
254 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.627685  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0567  enoyl-CoA hydratase  45.99 
 
 
259 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2333  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 
254 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0698  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 
280 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0860  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 
280 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0683  enoyl-CoA hydratase  45.99 
 
 
280 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2745  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 
280 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2413  enoyl-CoA hydratase  45.08 
 
 
280 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.921816  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.92 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3630  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.87 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.87 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287025  decreased coverage  0.00358317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0987  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2840  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.42 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.339924  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1748  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.57 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.828974  normal  0.0355231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0556  enoyl-CoA hydratase  42.92 
 
 
251 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.39 
 
 
260 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.768102 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0488  enoyl-CoA hydratase  38.27 
 
 
250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308254  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1846  enoyl-CoA hydratase  38.56 
 
 
263 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2587  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.97 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000356951  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3902  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.43 
 
 
254 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4289  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.16 
 
 
254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186398  normal  0.756398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3610  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.03 
 
 
254 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2804  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.57 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0776808  normal  0.568197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2760  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.57 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85821  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0835  enoyl-CoA hydratase  41.01 
 
 
220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0159384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>