More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2804 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_2804  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
252 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0776808  normal  0.568197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2760  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
252 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85821  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2790  enoyl-CoA hydratase/isomerase  99.21 
 
 
252 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.490827  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  71.95 
 
 
252 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.593041  normal  0.157117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3325  enoyl-CoA hydratase/isomerase  70 
 
 
250 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0340  enoyl-CoA hydratase/isomerase  62.87 
 
 
254 aa  275  4e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.486328  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2587  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.41 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000356951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.89 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1575  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.93 
 
 
250 aa  152  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00524815 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.17 
 
 
258 aa  149  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0855864 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0777  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
245 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0809  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
245 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.044471  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
245 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000721466  hitchhiker  0.00000000959721 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3582  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
245 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000838255  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0476  enoyl-CoA hydratase  39.36 
 
 
254 aa  148  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4199  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0335602  hitchhiker  0.000324097 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1086  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.59 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.08 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000610826 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3908  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.22 
 
 
245 aa  144  9e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4526  enoyl-CoA hydratase  39.34 
 
 
258 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3326  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3240  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
245 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596711  hitchhiker  0.0000100182 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0749  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
245 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.102863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0721  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
245 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000678732  hitchhiker  0.00168791 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0764  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.35 
 
 
245 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
254 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3229  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
245 aa  142  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547446  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.21 
 
 
262 aa  141  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0411  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
250 aa  138  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.477081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0540  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
245 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0616524  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0389  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
258 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00593018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  40.57 
 
 
263 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0388  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
254 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4163  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.44 
 
 
248 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.941221  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.68 
 
 
253 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0419  enoyl-CoA hydratase  35.77 
 
 
250 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.8 
 
 
246 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0450  enoyl-CoA hydratase  36.55 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0581  enoyl-CoA hydratase  39.68 
 
 
256 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  38.84 
 
 
261 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3512  enoyl-CoA hydratase  38.65 
 
 
254 aa  135  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.39 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.768102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0601  enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 
251 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.456666  normal  0.324394 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4035  enoyl-CoA hydratase  38.15 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.08 
 
 
245 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  32.48 
 
 
261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
253 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.234346  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3932  enoyl-CoA hydratase  38.21 
 
 
274 aa  132  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0527  enoyl-CoA hydratase  35.56 
 
 
249 aa  132  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.850744  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0987  enoyl-CoA hydratase  38.01 
 
 
252 aa  132  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6045  enoyl-CoA hydratase  45.2 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4299  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.98 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56250  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.69 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.01 
 
 
264 aa  130  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
262 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  33.89 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3336  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.68 
 
 
245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.212368  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  37.2 
 
 
260 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2745  enoyl-CoA hydratase  43.5 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0301258  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2688  enoyl-CoA hydratase  34.73 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000000387614  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2745  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.77 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0562194  normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2106  enoyl-CoA hydratase  43.5 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2718  enoyl-CoA hydratase  43.5 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.189949  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.24 
 
 
266 aa  126  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0664  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 
256 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556097  normal  0.974332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0471  enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 
258 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000928124  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1343  enoyl-CoA hydratase  34.54 
 
 
264 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.21 
 
 
260 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 
258 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3732  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.96 
 
 
248 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.407726  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
258 aa  125  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0684  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.42 
 
 
256 aa  125  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1056  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.83 
 
 
245 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.71 
 
 
259 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287025  decreased coverage  0.00358317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.35 
 
 
258 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3630  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.71 
 
 
259 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.85 
 
 
258 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2031  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 
248 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1748  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.19 
 
 
260 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.828974  normal  0.0355231 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2561  enoyl-CoA hydratase  32.66 
 
 
258 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000238691  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0544  enoyl-CoA hydratase  32.66 
 
 
258 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181699  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  37.2 
 
 
262 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1027  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
264 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.66 
 
 
279 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5771  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.71 
 
 
258 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  33.61 
 
 
259 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.89 
 
 
258 aa  122  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 
260 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.4 
 
 
262 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.4 
 
 
262 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574629 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0516  enoyl-CoA hydratase  33.89 
 
 
258 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000195576  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.8 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2840  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.31 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.339924  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4754  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.67 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0474  enoyl-CoA hydratase  33.89 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.0000000000253276  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0449  enoyl-CoA hydratase  33.89 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3544  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000159011  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.63 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2485  enoyl-CoA hydratase  35.44 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>