More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0835 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0835  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
220 aa  430  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0159384 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0450  enoyl-CoA hydratase  45.64 
 
 
258 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0476  enoyl-CoA hydratase  46.11 
 
 
254 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.62 
 
 
262 aa  148  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0389  enoyl-CoA hydratase  41.63 
 
 
258 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00593018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.79 
 
 
261 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0388  enoyl-CoA hydratase  42.78 
 
 
254 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02193  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
254 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.114495  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.61 
 
 
279 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.26 
 
 
245 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000721466  hitchhiker  0.00000000959721 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0540  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.05 
 
 
245 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0616524  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0809  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.26 
 
 
245 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.044471  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3582  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.26 
 
 
245 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000838255  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0777  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.26 
 
 
245 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160248  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  41.45 
 
 
254 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.58 
 
 
246 aa  137  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  41.45 
 
 
254 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0721  enoyl-CoA hydratase  37.26 
 
 
245 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000678732  hitchhiker  0.00168791 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4199  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
245 aa  136  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0335602  hitchhiker  0.000324097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0749  enoyl-CoA hydratase  37.26 
 
 
245 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.102863 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3908  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.26 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 
253 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.234346  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3240  enoyl-CoA hydratase  36.79 
 
 
245 aa  135  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596711  hitchhiker  0.0000100182 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4526  enoyl-CoA hydratase  41.36 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3326  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0764  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.32 
 
 
245 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0581  enoyl-CoA hydratase  41.74 
 
 
256 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0577  enoyl-CoA hydratase  39.72 
 
 
258 aa  134  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4299  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.58 
 
 
253 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0598  enoyl-CoA hydratase  39.72 
 
 
258 aa  134  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000610826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6045  enoyl-CoA hydratase  45.18 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2485  enoyl-CoA hydratase  36.67 
 
 
253 aa  131  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1899  enoyl-CoA hydratase  43.78 
 
 
258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3229  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.74 
 
 
245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547446  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.27 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1343  enoyl-CoA hydratase  40.1 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4035  enoyl-CoA hydratase  42.44 
 
 
256 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.81 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0855864 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.04 
 
 
245 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1027  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4029  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.32 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012375 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2745  enoyl-CoA hydratase  43.29 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0301258  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2106  enoyl-CoA hydratase  43.29 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2718  enoyl-CoA hydratase  43.29 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.189949  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.93 
 
 
264 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0987  enoyl-CoA hydratase  38.32 
 
 
252 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.24 
 
 
255 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4083  enoyl-CoA hydratase  43.46 
 
 
257 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543803  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0601  enoyl-CoA hydratase  37.38 
 
 
251 aa  124  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.456666  normal  0.324394 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5771  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.9 
 
 
258 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56250  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.89 
 
 
257 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2378  enoyl-CoA hydratase  39.35 
 
 
257 aa  121  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.0124738 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0664  enoyl-CoA hydratase  42.51 
 
 
256 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556097  normal  0.974332 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3473  enoyl-CoA hydratase  38.79 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0427069  normal  0.591102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3932  enoyl-CoA hydratase  40.19 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4899  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.45 
 
 
257 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.588442  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1575  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 
250 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00524815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1056  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.21 
 
 
245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0684  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.75 
 
 
256 aa  118  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2745  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.79 
 
 
258 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0562194  normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4449  enoyl-CoA hydratase  41.1 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0488  enoyl-CoA hydratase  37.09 
 
 
250 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308254  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0419  enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 
250 aa  115  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0411  enoyl-CoA hydratase  34.67 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.477081  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2636  enoyl-CoA hydratase  42.33 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0820  enoyl-CoA hydratase  39.91 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0527  enoyl-CoA hydratase  34.85 
 
 
249 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.850744  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3262  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.23 
 
 
257 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1748  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.49 
 
 
260 aa  112  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.828974  normal  0.0355231 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2770  enoyl-CoA hydratase  40.83 
 
 
255 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3732  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.29 
 
 
248 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.407726  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2861  enoyl-CoA hydratase  41.1 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.742849  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2031  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.29 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0556  enoyl-CoA hydratase  39.25 
 
 
251 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0567  enoyl-CoA hydratase  43.52 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3512  enoyl-CoA hydratase  39.35 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0698  enoyl-CoA hydratase  43.15 
 
 
280 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2333  enoyl-CoA hydratase  43.15 
 
 
254 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2745  enoyl-CoA hydratase  43.15 
 
 
280 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.27 
 
 
259 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287025  decreased coverage  0.00358317 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0200  enoyl-CoA hydratase  43.15 
 
 
254 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.627685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0683  enoyl-CoA hydratase  43.15 
 
 
280 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0860  enoyl-CoA hydratase  43.15 
 
 
280 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3630  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.27 
 
 
259 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2413  enoyl-CoA hydratase  43.15 
 
 
280 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.921816  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3336  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 
245 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.212368  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0414  enoyl-CoA hydratase  44.5 
 
 
256 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0435111  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2174  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
248 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.262533  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3828  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 
260 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.768102 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4068  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.63 
 
 
267 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0673  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.64 
 
 
241 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1813  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 
272 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1747  enoyl-CoA hydratase  36.68 
 
 
272 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1766  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 
272 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4754  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.35 
 
 
242 aa  102  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1985  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.84 
 
 
266 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33 
 
 
263 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3325  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.41 
 
 
250 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.482567  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.2 
 
 
257 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
252 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.593041  normal  0.157117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>