More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2482 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2482  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
267 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.27 
 
 
261 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  50.59 
 
 
261 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0060  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.6 
 
 
258 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.157267  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  48.44 
 
 
283 aa  178  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1836  enoyl-CoA hydratase  44.62 
 
 
270 aa  170  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.395714  normal  0.321075 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.62 
 
 
273 aa  168  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19430  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  47.24 
 
 
271 aa  165  9e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.71 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.22 
 
 
270 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0501  enoyl-CoA hydratase  46.12 
 
 
263 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1205  enoyl-CoA hydratase  43.31 
 
 
264 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.755368  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0702  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.36 
 
 
260 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.41 
 
 
257 aa  148  9e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  38.82 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  38.19 
 
 
263 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7944  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.97 
 
 
261 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  36.58 
 
 
263 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
263 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  37.16 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  37.16 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  37.16 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  37.16 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  37.16 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  37.16 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  37.16 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  38.29 
 
 
276 aa  136  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  35.52 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.2 
 
 
262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 
261 aa  135  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
263 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  36.05 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.82 
 
 
263 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  40.55 
 
 
263 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  38.55 
 
 
259 aa  132  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
263 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  38.78 
 
 
263 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  38.78 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  38.78 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 
273 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  38.87 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  39.37 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  33.73 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  38.49 
 
 
263 aa  125  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  33.84 
 
 
265 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
261 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  37.94 
 
 
263 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  39.17 
 
 
260 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
262 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
266 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0344  enoyl-CoA hydratase  33.86 
 
 
256 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458261  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.22 
 
 
267 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
259 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  36.02 
 
 
266 aa  122  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0707  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.39 
 
 
263 aa  122  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.266655  normal  0.60657 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 
256 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
267 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 
264 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  36.71 
 
 
265 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  33.85 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.57 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.6 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  37.77 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  34.59 
 
 
264 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2150  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
274 aa  118  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00228605  normal  0.0108638 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  38.98 
 
 
274 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.48 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  36.76 
 
 
262 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
262 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
262 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
267 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
262 aa  116  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  36.76 
 
 
262 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.52 
 
 
287 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1373  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.15 
 
 
266 aa  115  6e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.531782  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 
256 aa  115  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2188  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000498969  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  38.19 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0433  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.18 
 
 
249 aa  115  8.999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0427  enoyl-CoA hydratase  31.78 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000182955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>