More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0225 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0225  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
253 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05532  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.95 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0030451  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.43 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258792  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18064  predicted protein  32.05 
 
 
298 aa  126  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.13 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.06 
 
 
262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.6 
 
 
257 aa  111  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.79 
 
 
260 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
248 aa  108  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.33 
 
 
248 aa  108  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1416  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.99 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2045  enoyl-CoA hydratase  29.41 
 
 
230 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 
257 aa  105  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.72 
 
 
257 aa  105  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  32.54 
 
 
257 aa  105  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1739  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.96 
 
 
242 aa  105  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  29.25 
 
 
268 aa  104  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2912  enoyl-CoA hydratase  30.73 
 
 
252 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00810936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  32.8 
 
 
257 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28941  predicted protein  31.2 
 
 
265 aa  102  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00378929  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
262 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.89 
 
 
254 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0587  enoyl-CoA hydratase  30.05 
 
 
229 aa  99.8  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.98 
 
 
258 aa  99.8  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.11 
 
 
259 aa  99  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.7 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.12 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.29 
 
 
259 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.74 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.69 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0736  enoyl-CoA hydratase  27.78 
 
 
231 aa  96.3  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.97 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  31.67 
 
 
258 aa  96.3  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.41 
 
 
259 aa  96.3  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2131  enoyl-CoA hydratase  33.52 
 
 
259 aa  95.9  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.540792  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.86 
 
 
259 aa  95.9  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  34.86 
 
 
277 aa  95.9  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 
265 aa  95.5  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 
266 aa  95.5  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  29.05 
 
 
259 aa  95.1  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2282  enoyl-CoA hydratase  30.14 
 
 
237 aa  95.1  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.73 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  32.95 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.03 
 
 
260 aa  94.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1744  enoyl-CoA hydratase  30.59 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216387  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  32.11 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.28043  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.02 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.36 
 
 
259 aa  93.6  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.61 
 
 
257 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  30.95 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13055  enoyl-CoA hydratase  28 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2108  enoyl-CoA hydratase  28.64 
 
 
229 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430525  normal  0.0139564 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  29.64 
 
 
256 aa  92.8  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.18 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.18 
 
 
225 aa  92.4  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0094  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.8 
 
 
255 aa  92  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3560  enoyl-CoA hydratase  27.23 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.29 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.04 
 
 
659 aa  91.3  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13550  enoyl-CoA hydratase  31.52 
 
 
303 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.78 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.05 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000247495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.59 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
260 aa  90.5  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.08 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2522  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.04 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  33.14 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.61 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.67 
 
 
258 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.54 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0341  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.68 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
238 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.85 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2065  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  27 
 
 
229 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898876  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.92 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.05 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.09 
 
 
257 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.09 
 
 
257 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.38 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.05 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.09 
 
 
258 aa  89.7  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1454  enoyl-CoA hydratase  29.81 
 
 
229 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4169  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.79 
 
 
280 aa  89.4  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.41 
 
 
260 aa  89.4  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.69 
 
 
259 aa  89  6e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.41 
 
 
260 aa  89  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  27.51 
 
 
258 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.17 
 
 
259 aa  89  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.51 
 
 
258 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6065  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.95 
 
 
259 aa  89  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.638371  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  31.43 
 
 
260 aa  88.6  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.89 
 
 
258 aa  88.6  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  28.26 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  33.51 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>