More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2555 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0225  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.33 
 
 		 253 aa  108  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.19 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.2 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1739  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.34 
 
 		 242 aa  99  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2131  enoyl-CoA hydratase  27.54 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.540792  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3640  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.3 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28240  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  28.64 
 
 		 220 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0754  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.93 
 
 		 695 aa  94.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5263  hypothetical protein  29.52 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1498  enoyl-CoA hydratase  28.57 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1492  enoyl-CoA hydratase  27.19 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1400  enoyl-CoA hydratase  27.19 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1528  enoyl-CoA hydratase  27.19 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10643  enoyl-CoA hydratase  29.11 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000313119  normal  0.0554136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13550  enoyl-CoA hydratase  25.91 
 
 		 303 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2853  enoyl-CoA hydratase  27.27 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000407618 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1670  enoyl-CoA hydratase  27.51 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2946  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.37 
 
 		 220 aa  90.1  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000350804  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3660  enoyl-CoA hydratase  29.11 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1544  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  27.85 
 
 		 223 aa  89.7  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2473  enoyl-CoA hydratase  25.22 
 
 		 262 aa  89.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0123769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.26 
 
 		 267 aa  89  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01710  putative enoyl-CoA hydratase  27.85 
 
 		 238 aa  89  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104358  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6508  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.2 
 
 		 262 aa  88.6  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.451547  normal  0.193137 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.56 
 
 		 257 aa  88.6  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.16 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000198349  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.56 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.69 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.8 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.27 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  30.05 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.23 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0718  enoyl-CoA hydratase  29.11 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471174  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0655  enoyl-CoA hydratase/isomerase  23.85 
 
 		 261 aa  86.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.88 
 
 		 261 aa  86.3  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5646  enoyl-CoA hydratase  28.64 
 
 		 272 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.906008 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1789  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.26 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01705  enoyl-CoA hydratase  26.97 
 
 		 265 aa  85.9  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.834387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3199  enoyl-CoA hydratase  27.16 
 
 		 257 aa  85.5  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00556832 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4911  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.7 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.7 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.348513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2452  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.7 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.641383 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.87 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.5 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5130  enoyl-CoA hydratase  30.73 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.757985  normal  0.786684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  30.48 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.87 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7065  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.52 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.11 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0094  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.54 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.86 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.5 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.64 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1088  enoyl-CoA hydratase  28.16 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.571609  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1940  enoyl-CoA hydratase  28.4 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2661  enoyl-CoA hydratase  28.4 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.173157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0299  enoyl-CoA hydratase  26.26 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1680  enoyl-CoA hydratase  28.4 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.38 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1374  enoyl-CoA hydratase  23.81 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0833135  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2594  enoyl-CoA hydratase  28.4 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000334724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2768  enoyl-CoA hydratase  28.4 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.309342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0212  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.8 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06210  conserved hypothetical protein  28.85 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1378  enoyl-CoA hydratase  28.4 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.11 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  28.93 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0248  enoyl-CoA hydratase  28.65 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.03 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  26.13 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  26.79 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  31.28 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05485  enoyl-CoA hydratase  26.67 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30240  short chain enoyl-CoA hydratase /3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  28.65 
 
 		 728 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.39 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00829683  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.23 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  24.62 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  24.62 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  27.03 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.48 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6109  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  28.57 
 
 		 718 aa  80.1  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0984  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.38 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  26.58 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.8 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1071  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.13 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.540007 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.51 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.71 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.58 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  26.58 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1476  enoyl-CoA hydratase  27.41 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0195033 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  25.68 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.08 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  26.58 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  26.58 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.8 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  26.58 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>