More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0639 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
225 aa  448  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5263  hypothetical protein  56.74 
 
 
223 aa  248  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1544  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  54.88 
 
 
223 aa  239  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.05 
 
 
225 aa  236  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2452  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.42 
 
 
223 aa  234  9e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2946  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.7 
 
 
220 aa  219  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000350804  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28240  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  48.18 
 
 
220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0984  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.12 
 
 
236 aa  181  7e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1789  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.12 
 
 
235 aa  159  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.49 
 
 
236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00829683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4460  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.41 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01710  putative enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
238 aa  122  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 
238 aa  122  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000198349  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.2 
 
 
248 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06767  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G14850)  29.03 
 
 
244 aa  95.5  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.761527  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06210  conserved hypothetical protein  29.84 
 
 
266 aa  79  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02638  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.43 
 
 
218 aa  77  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10643  enoyl-CoA hydratase  31.19 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000313119  normal  0.0554136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1744  enoyl-CoA hydratase  29.9 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216387  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.38 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.4 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1454  enoyl-CoA hydratase  28.8 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2045  enoyl-CoA hydratase  26.2 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  32.1 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1739  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.22 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  32.34 
 
 
297 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.34 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1845  enoyl-CoA hydratase  28.18 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429815  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  29.36 
 
 
275 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  31.55 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  31.74 
 
 
261 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  32.34 
 
 
297 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  32.34 
 
 
297 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  32.34 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3865  enoyl-CoA hydratase  29.12 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  30.85 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.13 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0094  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.37 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3901  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  27.43 
 
 
729 aa  66.2  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  31.55 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.43 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577666  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.39 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  26.99 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.8 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2108  enoyl-CoA hydratase  29.12 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430525  normal  0.0139564 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0360  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  31.79 
 
 
696 aa  64.3  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1480  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.91 
 
 
259 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857901  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5125  enoyl-CoA hydratase  31.9 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1538  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.56 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
259 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  29.76 
 
 
261 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  31.16 
 
 
280 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  29.76 
 
 
261 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  30.36 
 
 
261 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  29.76 
 
 
261 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3216  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.53 
 
 
283 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.987087  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  29.76 
 
 
261 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1423  enoyl-CoA hydratase  28.73 
 
 
229 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293032  normal  0.655993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  30.25 
 
 
261 aa  62.8  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1875  enoyl-CoA hydratase  28.72 
 
 
229 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0754  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.88 
 
 
695 aa  62.8  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00460  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  26.82 
 
 
723 aa  62.4  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  27.06 
 
 
275 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.05 
 
 
257 aa  62  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001988  fatty oxidation complex alpha subunit FadB  26.82 
 
 
723 aa  62  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  27.66 
 
 
269 aa  62  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2912  enoyl-CoA hydratase  26.7 
 
 
252 aa  62  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00810936  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  29.44 
 
 
263 aa  62  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.44 
 
 
259 aa  62  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0015  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  27.43 
 
 
716 aa  62  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000759827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.56 
 
 
264 aa  62  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  28.5 
 
 
275 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4341  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.73 
 
 
276 aa  61.6  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.538809  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.77 
 
 
254 aa  61.6  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  30.86 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2642  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  0.778271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2065  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  27.27 
 
 
229 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898876  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1968  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.81 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.503691  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  27.57 
 
 
280 aa  61.6  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.49 
 
 
262 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3949  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  26.76 
 
 
729 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.706953  normal  0.0634882 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1226  enoyl-CoA hydratase  29.53 
 
 
233 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146612  normal  0.418232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  28.43 
 
 
263 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4679  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.57 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.02 
 
 
259 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  30.61 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04074  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
258 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  30.27 
 
 
260 aa  59.7  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3804  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
258 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.482495 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04036  hypothetical protein  28.57 
 
 
260 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.13651  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3640  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.31 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0096  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
267 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.03 
 
 
273 aa  59.3  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.14 
 
 
260 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4213  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  27.43 
 
 
729 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  26.11 
 
 
262 aa  58.9  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4369  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  27.43 
 
 
771 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3560  enoyl-CoA hydratase  26.29 
 
 
229 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  29.95 
 
 
263 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.51 
 
 
260 aa  58.9  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>