More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02638 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02638  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  100 
 
 
218 aa  442  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2642  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.11 
 
 
235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  0.778271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3560  enoyl-CoA hydratase  43.69 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41950  enoyl-CoA hydratase  42.23 
 
 
229 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2108  enoyl-CoA hydratase  39.52 
 
 
229 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430525  normal  0.0139564 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2045  enoyl-CoA hydratase  38.32 
 
 
230 aa  152  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1875  enoyl-CoA hydratase  39.34 
 
 
229 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1744  enoyl-CoA hydratase  40.28 
 
 
229 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216387  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1454  enoyl-CoA hydratase  41.26 
 
 
229 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5125  enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 
233 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3865  enoyl-CoA hydratase  40.78 
 
 
229 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0587  enoyl-CoA hydratase  40.38 
 
 
229 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2912  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
252 aa  148  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00810936  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1845  enoyl-CoA hydratase  40.29 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429815  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 
238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2282  enoyl-CoA hydratase  37.04 
 
 
237 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2065  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.1 
 
 
229 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898876  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1423  enoyl-CoA hydratase  40.78 
 
 
229 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293032  normal  0.655993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1226  enoyl-CoA hydratase  39.81 
 
 
233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146612  normal  0.418232 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0911  enoyl-CoA hydratase  39.44 
 
 
248 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0928  enoyl-CoA hydratase  39.44 
 
 
248 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0918  enoyl-CoA hydratase  39.44 
 
 
232 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10643  enoyl-CoA hydratase  36.32 
 
 
231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000313119  normal  0.0554136 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0736  enoyl-CoA hydratase  35.24 
 
 
231 aa  134  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.01 
 
 
248 aa  92  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18064  predicted protein  27.6 
 
 
298 aa  91.7  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2946  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.06 
 
 
220 aa  88.2  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000350804  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0225  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25 
 
 
253 aa  87  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1544  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  27.49 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1739  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.63 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.27 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000247495  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.15 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299602  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.33 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2452  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.57 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.19 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05532  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  27.23 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0030451  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  29.59 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2522  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.54 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.39 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5263  hypothetical protein  31.02 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.11 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  27.98 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1480  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.47 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857901  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3378  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.83 
 
 
721 aa  72.4  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.67 
 
 
257 aa  72  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.05 
 
 
259 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  28.29 
 
 
268 aa  71.6  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  25.56 
 
 
257 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  27.67 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28460  short chain enoyl-CoA hydratase  27.38 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528871  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2522  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.218751  normal  0.701795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.67 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.37 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.53 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1376  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.47 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2124  naphthoate synthase  27.62 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000363984  normal  0.0450036 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3640  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.67 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0650  putative crotonase  29.05 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3671  short chain enoyl-CoA hydratase  29.35 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.120291  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.87 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49128  predicted protein  27.23 
 
 
722 aa  69.7  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.769408 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.5 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  25.13 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3658  short chain enoyl-CoA hydratase  29.89 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3731  short chain enoyl-CoA hydratase  29.89 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.72 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0261  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.5 
 
 
729 aa  69.3  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.86607  normal  0.0441662 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4093  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.69 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.18 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0283  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.5 
 
 
729 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00882549  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.11 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3933  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.5 
 
 
729 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.18 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1912  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.5 
 
 
729 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.539426  normal  0.0186555 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  28.06 
 
 
257 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  29.19 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28240  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  24.12 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3662  short chain enoyl-CoA hydratase  29 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.745999  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.05 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.32 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.7 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.42 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2534  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.8 
 
 
723 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.386757  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  30.37 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.06 
 
 
258 aa  67  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1338  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.71 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.9 
 
 
254 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.09 
 
 
262 aa  67  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0387  enoyl-CoA hydratase  27.49 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.01 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  28.28 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4136  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.28 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_004310  BR2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.28 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577666  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  28.12 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12770  Enoyl-CoA hydratase  29.67 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0941  enoyl-CoA hydratase  26.17 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  27.32 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  28.06 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>