More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1423 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1423  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
229 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293032  normal  0.655993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1845  enoyl-CoA hydratase  96.51 
 
 
229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429815  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3865  enoyl-CoA hydratase  96.51 
 
 
229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1454  enoyl-CoA hydratase  90.83 
 
 
229 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1744  enoyl-CoA hydratase  83.84 
 
 
229 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216387  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2108  enoyl-CoA hydratase  78.51 
 
 
229 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430525  normal  0.0139564 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41950  enoyl-CoA hydratase  78.17 
 
 
229 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2065  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  77.63 
 
 
229 aa  371  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898876  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3560  enoyl-CoA hydratase  75.98 
 
 
229 aa  362  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1875  enoyl-CoA hydratase  75 
 
 
229 aa  360  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2282  enoyl-CoA hydratase  68 
 
 
237 aa  320  8e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2912  enoyl-CoA hydratase  60.09 
 
 
252 aa  289  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00810936  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2045  enoyl-CoA hydratase  62.33 
 
 
230 aa  280  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0587  enoyl-CoA hydratase  56 
 
 
229 aa  257  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.78 
 
 
238 aa  179  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10643  enoyl-CoA hydratase  41.96 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000313119  normal  0.0554136 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0736  enoyl-CoA hydratase  38.74 
 
 
231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5125  enoyl-CoA hydratase  42.04 
 
 
233 aa  152  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02638  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  40.78 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0928  enoyl-CoA hydratase  41.3 
 
 
248 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0918  enoyl-CoA hydratase  41.3 
 
 
232 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0911  enoyl-CoA hydratase  41.3 
 
 
248 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2642  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.54 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  0.778271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1226  enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 
233 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146612  normal  0.418232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0225  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.52 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4169  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.34 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0094  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.17 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18064  predicted protein  26.91 
 
 
298 aa  75.1  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05532  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.95 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0030451  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.5 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  29.38 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  30.05 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.6 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.73 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.35 
 
 
275 aa  68.6  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  31 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 
262 aa  67  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.69 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  27.71 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1739  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.22 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.62 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1544  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.29 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2946  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000350804  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  30.1 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.02 
 
 
260 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2829  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.54 
 
 
265 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2067  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  27.23 
 
 
654 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.05 
 
 
262 aa  62.8  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.7 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  22.69 
 
 
263 aa  62.4  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  22.69 
 
 
263 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.73 
 
 
259 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.08 
 
 
254 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5263  hypothetical protein  29.84 
 
 
223 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.61 
 
 
259 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.02 
 
 
263 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  30.93 
 
 
275 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2453  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  34.59 
 
 
702 aa  62  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  27.08 
 
 
288 aa  62  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2765  short chain enoyl-CoA hydratase  29 
 
 
274 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.07 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.22 
 
 
260 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.72 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  33.69 
 
 
270 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.03 
 
 
264 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  32.35 
 
 
263 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.66 
 
 
260 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  30.93 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.38 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  26.58 
 
 
269 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.73 
 
 
257 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.98 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.35 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.56 
 
 
255 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 
279 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.48 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4532  enoyl-CoA hydratase  30.3 
 
 
255 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.17 
 
 
260 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.75 
 
 
269 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.62 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.234346  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  27.27 
 
 
268 aa  59.3  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_004310  BR2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.42 
 
 
258 aa  59.3  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577666  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  29.74 
 
 
261 aa  58.9  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1480  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.18 
 
 
259 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857901  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3890  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.31 
 
 
711 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0297605  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  27.22 
 
 
280 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4465  enoyl-CoA hydratase  40.18 
 
 
252 aa  58.9  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0779435  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  26.4 
 
 
268 aa  58.5  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1376  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.18 
 
 
259 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.39 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.16 
 
 
270 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.56 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.24 
 
 
259 aa  57.8  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2754  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  30.24 
 
 
703 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.693173  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.68 
 
 
269 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.86 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>