More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2045 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2045  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
230 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1875  enoyl-CoA hydratase  63.68 
 
 
229 aa  291  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2065  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  63.68 
 
 
229 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898876  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2108  enoyl-CoA hydratase  63.68 
 
 
229 aa  290  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430525  normal  0.0139564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3560  enoyl-CoA hydratase  62.33 
 
 
229 aa  287  9e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2912  enoyl-CoA hydratase  61.26 
 
 
252 aa  286  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00810936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41950  enoyl-CoA hydratase  62.33 
 
 
229 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1845  enoyl-CoA hydratase  61.88 
 
 
229 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429815  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1454  enoyl-CoA hydratase  62.78 
 
 
229 aa  278  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3865  enoyl-CoA hydratase  61.43 
 
 
229 aa  278  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1423  enoyl-CoA hydratase  62.33 
 
 
229 aa  275  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293032  normal  0.655993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1744  enoyl-CoA hydratase  60.09 
 
 
229 aa  275  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216387  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2282  enoyl-CoA hydratase  57.46 
 
 
237 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0587  enoyl-CoA hydratase  58.3 
 
 
229 aa  261  8e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.39 
 
 
238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10643  enoyl-CoA hydratase  37.27 
 
 
231 aa  154  8e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000313119  normal  0.0554136 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02638  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.32 
 
 
218 aa  152  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2642  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.55 
 
 
235 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  0.778271 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5125  enoyl-CoA hydratase  40.55 
 
 
233 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0918  enoyl-CoA hydratase  40.27 
 
 
232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0911  enoyl-CoA hydratase  40.27 
 
 
248 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0928  enoyl-CoA hydratase  40.27 
 
 
248 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0736  enoyl-CoA hydratase  34.09 
 
 
231 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1226  enoyl-CoA hydratase  39.82 
 
 
233 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146612  normal  0.418232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0225  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.41 
 
 
253 aa  107  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.95 
 
 
260 aa  88.6  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.48 
 
 
260 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18064  predicted protein  31.58 
 
 
298 aa  87  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.41 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1739  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.96 
 
 
242 aa  81.6  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05532  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.1 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0030451  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.81 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4169  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.24 
 
 
280 aa  79  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.56 
 
 
258 aa  78.6  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577666  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0094  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.22 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
254 aa  78.2  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.86 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  29.95 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.94 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.05 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000247495  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0145  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  30.21 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.22 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.23 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1968  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.503691  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.89 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.79 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  26.73 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.67 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.11 
 
 
256 aa  72  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0684  methylmalonyl-CoA decarboxylase  27.85 
 
 
259 aa  72  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0753206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.72 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.12 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258792  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  26.07 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.2 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0754  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.37 
 
 
695 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.18 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.77 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  26.24 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0696  methylmalonyl-CoA decarboxylase  26.94 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000012263 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  26.24 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  26.24 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  26.24 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  26.24 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  26.24 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  28.14 
 
 
661 aa  69.3  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  26.24 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.4 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  26.24 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.92 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.42 
 
 
258 aa  68.6  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.92 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.92 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  29.41 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.89 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  25.74 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2946  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.88 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000350804  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.11 
 
 
259 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  25.74 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  28.57 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.34 
 
 
258 aa  67  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0655  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.05 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29 
 
 
260 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2111  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  25.81 
 
 
714 aa  67  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.344014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.2 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3556  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  30.12 
 
 
717 aa  66.6  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.461613  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0015  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  27.31 
 
 
716 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000759827  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0071566  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3267  short chain enoyl-CoA hydratase  26.9 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49128  predicted protein  24.42 
 
 
722 aa  65.5  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.769408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2522  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.8 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.218751  normal  0.701795 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06210  conserved hypothetical protein  25.38 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.69 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.83 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.13 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3671  short chain enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.120291  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3658  short chain enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3731  short chain enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5442  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  28.23 
 
 
692 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>