More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2108 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_2108  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
229 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430525  normal  0.0139564 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1744  enoyl-CoA hydratase  83.77 
 
 
229 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216387  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41950  enoyl-CoA hydratase  82.89 
 
 
229 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3560  enoyl-CoA hydratase  80.7 
 
 
229 aa  391  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1845  enoyl-CoA hydratase  78.51 
 
 
229 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429815  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2065  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  81.22 
 
 
229 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898876  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1875  enoyl-CoA hydratase  79.91 
 
 
229 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3865  enoyl-CoA hydratase  77.63 
 
 
229 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1423  enoyl-CoA hydratase  78.51 
 
 
229 aa  377  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293032  normal  0.655993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1454  enoyl-CoA hydratase  77.19 
 
 
229 aa  370  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2282  enoyl-CoA hydratase  74.22 
 
 
237 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2912  enoyl-CoA hydratase  61.4 
 
 
252 aa  298  5e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00810936  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2045  enoyl-CoA hydratase  63.68 
 
 
230 aa  290  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0587  enoyl-CoA hydratase  57.33 
 
 
229 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.67 
 
 
238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10643  enoyl-CoA hydratase  39.73 
 
 
231 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000313119  normal  0.0554136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5125  enoyl-CoA hydratase  42.67 
 
 
233 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0736  enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 
231 aa  156  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02638  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  39.52 
 
 
218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2642  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.6 
 
 
235 aa  151  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  0.778271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1226  enoyl-CoA hydratase  42.22 
 
 
233 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146612  normal  0.418232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0918  enoyl-CoA hydratase  39.11 
 
 
232 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0911  enoyl-CoA hydratase  39.11 
 
 
248 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0928  enoyl-CoA hydratase  39.11 
 
 
248 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0225  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.64 
 
 
253 aa  93.2  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18064  predicted protein  28.75 
 
 
298 aa  89.4  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  32.84 
 
 
264 aa  82  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0094  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.47 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.4 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  31.16 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.56 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.15 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.19 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1739  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.72 
 
 
242 aa  72  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.95 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.49 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  24.17 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  24.17 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.09 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_004310  BR2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.15 
 
 
258 aa  68.6  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577666  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  31.09 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.62 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.27 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  31.86 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1480  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.65 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857901  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.65 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.79 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05532  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  26.63 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0030451  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.15 
 
 
255 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.46 
 
 
259 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2754  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  32.83 
 
 
703 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.693173  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.73 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.92 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  26.22 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4169  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.27 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.42 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.12 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.02 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.94 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.23 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 
279 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.94 
 
 
269 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2131  enoyl-CoA hydratase  29.95 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.540792  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.12 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2946  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.41 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000350804  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0408  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.02 
 
 
724 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1968  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.6 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.503691  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1376  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.2 
 
 
259 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6084  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.69 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.12 
 
 
274 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3890  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  29.65 
 
 
711 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0297605  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.85 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.67 
 
 
263 aa  62.4  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  28.25 
 
 
280 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  31.05 
 
 
270 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4435  enoyl-CoA hydratase  32.16 
 
 
272 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0396852 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  26.73 
 
 
261 aa  62  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0436  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  27.54 
 
 
725 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.72 
 
 
259 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2765  short chain enoyl-CoA hydratase  26.54 
 
 
274 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.75 
 
 
269 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2829  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.22 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0437  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  27.05 
 
 
725 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.09 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.42 
 
 
258 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4465  enoyl-CoA hydratase  32.1 
 
 
252 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0779435  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  28.09 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1544  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.24 
 
 
223 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3833  enoyl-CoA hydratase  28.86 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  29.13 
 
 
267 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.69 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2453  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  27.87 
 
 
702 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889679  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  24.55 
 
 
262 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  28.34 
 
 
261 aa  60.1  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1238  enoyl-CoA hydratase  30.3 
 
 
274 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.4006  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.7 
 
 
261 aa  60.1  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  26.79 
 
 
257 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3671  short chain enoyl-CoA hydratase  25.64 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.120291  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3658  short chain enoyl-CoA hydratase  25.64 
 
 
238 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4532  enoyl-CoA hydratase  29.38 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>