More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1744 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1744  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
229 aa  461  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216387  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3865  enoyl-CoA hydratase  83.41 
 
 
229 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1845  enoyl-CoA hydratase  82.97 
 
 
229 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429815  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2108  enoyl-CoA hydratase  83.77 
 
 
229 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430525  normal  0.0139564 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2065  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  81.58 
 
 
229 aa  387  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898876  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1423  enoyl-CoA hydratase  83.84 
 
 
229 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293032  normal  0.655993 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1875  enoyl-CoA hydratase  79.82 
 
 
229 aa  380  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41950  enoyl-CoA hydratase  80.35 
 
 
229 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1454  enoyl-CoA hydratase  81.66 
 
 
229 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3560  enoyl-CoA hydratase  79.04 
 
 
229 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2282  enoyl-CoA hydratase  69.33 
 
 
237 aa  328  6e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2912  enoyl-CoA hydratase  61.4 
 
 
252 aa  295  4e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00810936  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2045  enoyl-CoA hydratase  60.09 
 
 
230 aa  275  5e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0587  enoyl-CoA hydratase  56 
 
 
229 aa  252  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 
238 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10643  enoyl-CoA hydratase  41.04 
 
 
231 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000313119  normal  0.0554136 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0736  enoyl-CoA hydratase  37.84 
 
 
231 aa  155  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02638  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  40.28 
 
 
218 aa  150  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5125  enoyl-CoA hydratase  40.18 
 
 
233 aa  142  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2642  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.55 
 
 
235 aa  134  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  0.778271 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0918  enoyl-CoA hydratase  39.56 
 
 
232 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0911  enoyl-CoA hydratase  39.56 
 
 
248 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0928  enoyl-CoA hydratase  39.56 
 
 
248 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1226  enoyl-CoA hydratase  38.6 
 
 
233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146612  normal  0.418232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0225  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.59 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0094  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.05 
 
 
255 aa  86.3  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18064  predicted protein  28.45 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4169  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.03 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.99 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05532  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  27.64 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0030451  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  32.12 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_004310  BR2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.09 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577666  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.37 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1739  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.22 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.9 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.17 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.62 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.51 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1968  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.55 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.503691  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.81 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 
263 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  31.41 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  29.53 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2829  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.92 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1544  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.9 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4874  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.78 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.44 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.68 
 
 
274 aa  65.1  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.38 
 
 
269 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1480  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857901  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.89 
 
 
258 aa  63.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0018  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.58 
 
 
717 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.74 
 
 
258 aa  63.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.18 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  30.69 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.82 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  27.56 
 
 
268 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1376  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.97 
 
 
259 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.03 
 
 
253 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.234346  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.73 
 
 
279 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1905  enoyl-CoA hydratase  29.41 
 
 
216 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.888285  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1839  enoyl-CoA hydratase  29.41 
 
 
216 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.952536  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.41 
 
 
216 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.72 
 
 
263 aa  62.4  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
262 aa  62.4  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.22 
 
 
275 aa  62.4  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2946  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.88 
 
 
220 aa  62  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000350804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0145  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.8 
 
 
268 aa  62  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.12 
 
 
255 aa  62  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.62 
 
 
258 aa  62  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258792  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0021  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.85 
 
 
716 aa  62  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0734076  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3731  short chain enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
238 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3658  short chain enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
238 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.34 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3943  enoyl-CoA hydratase  30.52 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5245  enoyl-CoA hydratase  29.28 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2754  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  31.34 
 
 
703 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.693173  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  27.36 
 
 
260 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0023  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.17 
 
 
716 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1856  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.46 
 
 
263 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128086  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3671  short chain enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.120291  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.23 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3556  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  28.18 
 
 
717 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.461613  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  29.21 
 
 
275 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5263  hypothetical protein  29.95 
 
 
223 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.49 
 
 
269 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.27 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2452  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.03 
 
 
223 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.45 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2453  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  33.08 
 
 
702 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.89 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.87 
 
 
273 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.59 
 
 
254 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0016  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.23 
 
 
716 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00124169  normal  0.0928746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2854  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  31.15 
 
 
696 aa  59.7  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0436  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  33.59 
 
 
725 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2144  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.07 
 
 
253 aa  59.3  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268897  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>