More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3943 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_3943  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
256 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3304  enoyl-CoA hydratase  76.17 
 
 
256 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2115  enoyl-CoA hydratase  76.95 
 
 
281 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.322248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3576  enoyl-CoA hydratase  70.31 
 
 
256 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.706787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5245  enoyl-CoA hydratase  55.34 
 
 
258 aa  278  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5107  enoyl-CoA hydratase  50.79 
 
 
258 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014973  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4225  enoyl-CoA hydratase  47.49 
 
 
267 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1660  enoyl-CoA hydratase  51.44 
 
 
254 aa  245  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0508475  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4618  enoyl-CoA hydratase  45.2 
 
 
264 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.246511  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0802  enoyl-CoA hydratase  46.4 
 
 
262 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.3 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
260 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  34.26 
 
 
258 aa  138  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.16 
 
 
260 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.52 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.65 
 
 
257 aa  132  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
265 aa  131  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.9 
 
 
257 aa  131  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.13 
 
 
258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.61 
 
 
258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.95 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.78 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1645  short chain enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
257 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  31.12 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.52 
 
 
260 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.23 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.13 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.68 
 
 
256 aa  125  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.15 
 
 
261 aa  125  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.12 
 
 
260 aa  125  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.31 
 
 
261 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 
260 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.92 
 
 
260 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.33 
 
 
268 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.54 
 
 
260 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.77 
 
 
252 aa  122  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
259 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.67 
 
 
260 aa  121  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.65 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  30.57 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2902  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.88 
 
 
650 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.67 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.51 
 
 
260 aa  120  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.4 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2029  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.65 
 
 
269 aa  119  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  33.06 
 
 
260 aa  119  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  31.64 
 
 
263 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.1 
 
 
269 aa  118  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.23 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.67 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  29.92 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.12 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28460  short chain enoyl-CoA hydratase  34.36 
 
 
259 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528871  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.88 
 
 
260 aa  116  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 
261 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
260 aa  115  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.48 
 
 
258 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490651  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  30.36 
 
 
263 aa  115  6e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 
265 aa  115  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.51 
 
 
256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 
261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.72 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  29.11 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  28.23 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000379  methylglutaconyl-CoA hydratase  30.68 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4190  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.3 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164544  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0102  enoyl-CoA hydratase  31.67 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.3 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.87 
 
 
262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.71 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 
259 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  28.46 
 
 
258 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  34.44 
 
 
262 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.06 
 
 
267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  28.46 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  31.3 
 
 
283 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  28.92 
 
 
264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  29.05 
 
 
262 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.23 
 
 
259 aa  112  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.4 
 
 
255 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  29.27 
 
 
278 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2094  enoyl-CoA hydratase  31.43 
 
 
257 aa  112  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0329811  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  31.23 
 
 
277 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
259 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.75 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  34.65 
 
 
262 aa  111  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  32.26 
 
 
257 aa  111  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  31.87 
 
 
262 aa  111  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  28.74 
 
 
264 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1196  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 
261 aa  111  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0109  enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>