More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2065 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2065  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  100 
 
 
229 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898876  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1875  enoyl-CoA hydratase  94.32 
 
 
229 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1744  enoyl-CoA hydratase  81.58 
 
 
229 aa  387  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216387  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2108  enoyl-CoA hydratase  81.22 
 
 
229 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430525  normal  0.0139564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1845  enoyl-CoA hydratase  76.32 
 
 
229 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429815  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3865  enoyl-CoA hydratase  76.75 
 
 
229 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41950  enoyl-CoA hydratase  77.19 
 
 
229 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1423  enoyl-CoA hydratase  77.63 
 
 
229 aa  362  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293032  normal  0.655993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1454  enoyl-CoA hydratase  76.32 
 
 
229 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3560  enoyl-CoA hydratase  75.88 
 
 
229 aa  359  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2282  enoyl-CoA hydratase  72.44 
 
 
237 aa  340  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2912  enoyl-CoA hydratase  60.53 
 
 
252 aa  291  6e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00810936  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2045  enoyl-CoA hydratase  63.68 
 
 
230 aa  290  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0587  enoyl-CoA hydratase  60 
 
 
229 aa  271  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.33 
 
 
238 aa  189  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10643  enoyl-CoA hydratase  40.62 
 
 
231 aa  166  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000313119  normal  0.0554136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5125  enoyl-CoA hydratase  42.67 
 
 
233 aa  155  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0736  enoyl-CoA hydratase  36.49 
 
 
231 aa  148  8e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0911  enoyl-CoA hydratase  42.04 
 
 
248 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0928  enoyl-CoA hydratase  42.04 
 
 
248 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0918  enoyl-CoA hydratase  42.04 
 
 
232 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02638  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  38.1 
 
 
218 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1226  enoyl-CoA hydratase  41.33 
 
 
233 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146612  normal  0.418232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2642  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.67 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  0.778271 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18064  predicted protein  30.42 
 
 
298 aa  92  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0225  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1739  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.2 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0094  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.12 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.51 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  30.88 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.7 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.68 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4169  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.03 
 
 
280 aa  72  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05532  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  27.54 
 
 
256 aa  72  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0030451  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0145  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.29 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.41 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577666  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1544  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.99 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.25 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.23 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5263  hypothetical protein  31.89 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.9 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.99 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  32.8 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  29.29 
 
 
262 aa  67  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2946  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000350804  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.93 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.94 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2452  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.27 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.07 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  31.22 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.94 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1968  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.88 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.503691  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.22 
 
 
263 aa  65.1  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4465  enoyl-CoA hydratase  36.75 
 
 
252 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0779435  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  23.18 
 
 
263 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  23.18 
 
 
263 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.22 
 
 
273 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2754  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  32.83 
 
 
703 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.693173  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0436  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  33.09 
 
 
725 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.47 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.12 
 
 
262 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0408  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  33.09 
 
 
724 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1605  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.28 
 
 
721 aa  63.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000436351  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.23 
 
 
262 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0437  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  33.59 
 
 
725 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  28.79 
 
 
275 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  25.86 
 
 
268 aa  62.8  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.65 
 
 
256 aa  62.8  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0023  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  27.78 
 
 
716 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.29 
 
 
258 aa  62.4  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.19 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  28.1 
 
 
260 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.56 
 
 
270 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.76 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.27 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  27.78 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0021  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  27.4 
 
 
716 aa  61.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0734076  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  27.78 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.53 
 
 
262 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.23 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1480  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.96 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857901  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.14 
 
 
257 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  27.78 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1376  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.28 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  27.51 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  27.27 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  27.27 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  27.27 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  27.27 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.76 
 
 
268 aa  60.1  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  27.27 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  27.27 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28460  short chain enoyl-CoA hydratase  29.46 
 
 
259 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528871  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4093  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.24 
 
 
261 aa  59.7  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2522  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
238 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.218751  normal  0.701795 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.36 
 
 
263 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0018  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  27.7 
 
 
717 aa  59.3  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27 
 
 
256 aa  58.9  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000247495  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  25.21 
 
 
288 aa  58.9  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.06 
 
 
254 aa  58.9  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>