More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1875 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1875  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
229 aa  463  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2065  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  94.32 
 
 
229 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898876  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1744  enoyl-CoA hydratase  79.82 
 
 
229 aa  380  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216387  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2108  enoyl-CoA hydratase  79.91 
 
 
229 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430525  normal  0.0139564 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41950  enoyl-CoA hydratase  76.32 
 
 
229 aa  362  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3560  enoyl-CoA hydratase  75.44 
 
 
229 aa  358  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3865  enoyl-CoA hydratase  74.12 
 
 
229 aa  358  4e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1845  enoyl-CoA hydratase  73.68 
 
 
229 aa  358  5e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429815  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1454  enoyl-CoA hydratase  74.56 
 
 
229 aa  353  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1423  enoyl-CoA hydratase  75 
 
 
229 aa  352  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293032  normal  0.655993 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2282  enoyl-CoA hydratase  71.56 
 
 
237 aa  338  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2045  enoyl-CoA hydratase  63.68 
 
 
230 aa  291  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2912  enoyl-CoA hydratase  60.53 
 
 
252 aa  291  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00810936  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0587  enoyl-CoA hydratase  59.11 
 
 
229 aa  267  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.33 
 
 
238 aa  189  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10643  enoyl-CoA hydratase  41.07 
 
 
231 aa  166  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000313119  normal  0.0554136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5125  enoyl-CoA hydratase  42.67 
 
 
233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0736  enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 
231 aa  152  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02638  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  39.34 
 
 
218 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0911  enoyl-CoA hydratase  42.48 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0918  enoyl-CoA hydratase  42.48 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0928  enoyl-CoA hydratase  42.48 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1226  enoyl-CoA hydratase  42.22 
 
 
233 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146612  normal  0.418232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2642  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.12 
 
 
235 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  0.778271 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18064  predicted protein  31.08 
 
 
298 aa  90.5  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0225  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.09 
 
 
253 aa  85.1  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1739  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.23 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  30.88 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0094  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.12 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.41 
 
 
248 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.94 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.15 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.88 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.7 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05532  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.02 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0030451  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.95 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577666  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.9 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.05 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.84 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1544  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.57 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2754  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  33.84 
 
 
703 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.693173  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0145  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.33 
 
 
268 aa  68.2  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2452  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.35 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.36 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.88 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.03 
 
 
258 aa  67  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  30.05 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1605  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.73 
 
 
721 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000436351  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4169  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.66 
 
 
280 aa  67  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5263  hypothetical protein  31.89 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1968  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.41 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.503691  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.94 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0023  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.17 
 
 
716 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.21 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0021  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  27.88 
 
 
716 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0734076  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  29.55 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.93 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  32.26 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2946  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.7 
 
 
220 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000350804  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4465  enoyl-CoA hydratase  31.84 
 
 
252 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0779435  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.14 
 
 
256 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  28.79 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.49 
 
 
254 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.21 
 
 
263 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.65 
 
 
256 aa  63.2  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.1 
 
 
257 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0436  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  33.09 
 
 
725 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.72 
 
 
225 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  22.75 
 
 
263 aa  62.8  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  22.75 
 
 
263 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
262 aa  62.8  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  28.28 
 
 
258 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0408  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  33.09 
 
 
724 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0437  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  32.37 
 
 
725 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  28.28 
 
 
258 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  26.07 
 
 
288 aa  62.4  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  25.86 
 
 
268 aa  62  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  28.77 
 
 
257 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.4 
 
 
273 aa  62  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.79 
 
 
258 aa  62  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  27.78 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  27.78 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  27.78 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  27.78 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1221  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.05 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212556  normal  0.0915283 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  27.78 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1480  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.32 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857901  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  27.78 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.75 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0032  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  27.23 
 
 
716 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58594  normal  0.0455208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1880  enoyl-CoA hydratase  37.32 
 
 
257 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0910534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1376  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.32 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  29.91 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.85 
 
 
262 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.92 
 
 
256 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000247495  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.64 
 
 
262 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.31 
 
 
257 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4093  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.74 
 
 
261 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  27.18 
 
 
257 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>