More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1454 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1454  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
229 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1845  enoyl-CoA hydratase  89.52 
 
 
229 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429815  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3865  enoyl-CoA hydratase  89.08 
 
 
229 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1423  enoyl-CoA hydratase  90.83 
 
 
229 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293032  normal  0.655993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1744  enoyl-CoA hydratase  81.66 
 
 
229 aa  378  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216387  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2108  enoyl-CoA hydratase  77.19 
 
 
229 aa  370  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430525  normal  0.0139564 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2065  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  76.32 
 
 
229 aa  360  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898876  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3560  enoyl-CoA hydratase  75.98 
 
 
229 aa  359  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41950  enoyl-CoA hydratase  75.98 
 
 
229 aa  357  8e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1875  enoyl-CoA hydratase  74.56 
 
 
229 aa  353  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2282  enoyl-CoA hydratase  70.22 
 
 
237 aa  329  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2912  enoyl-CoA hydratase  61.61 
 
 
252 aa  285  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00810936  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2045  enoyl-CoA hydratase  62.78 
 
 
230 aa  278  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0587  enoyl-CoA hydratase  57.33 
 
 
229 aa  256  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.33 
 
 
238 aa  178  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10643  enoyl-CoA hydratase  41.96 
 
 
231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000313119  normal  0.0554136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5125  enoyl-CoA hydratase  42.48 
 
 
233 aa  155  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0911  enoyl-CoA hydratase  42.04 
 
 
248 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0928  enoyl-CoA hydratase  42.04 
 
 
248 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02638  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  41.26 
 
 
218 aa  149  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0918  enoyl-CoA hydratase  42.04 
 
 
232 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1226  enoyl-CoA hydratase  42.48 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146612  normal  0.418232 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0736  enoyl-CoA hydratase  36.77 
 
 
231 aa  145  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2642  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.59 
 
 
235 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  0.778271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0225  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.81 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18064  predicted protein  28.7 
 
 
298 aa  82.4  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0094  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.17 
 
 
255 aa  78.2  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.05 
 
 
248 aa  75.1  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1739  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.21 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  32 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  31.94 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  24.79 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  24.79 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.06 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.8 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1544  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.5 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4169  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.45 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.86 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.92 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.07 
 
 
258 aa  68.6  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1575  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.54 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.980985  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0558  enoyl-CoA hydratase  30.14 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05532  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  27.89 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0030451  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.97 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4093  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.13 
 
 
261 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0914  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.64 
 
 
269 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.49 
 
 
254 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.85 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.98 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.29 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2765  short chain enoyl-CoA hydratase  30.5 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.57 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.61 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.28 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.18 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.39 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
263 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.19 
 
 
258 aa  65.1  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2829  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.78 
 
 
265 aa  65.1  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.09 
 
 
256 aa  65.1  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  27.06 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.94 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  30.61 
 
 
275 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.81 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2453  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  29.79 
 
 
702 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889679  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.83 
 
 
264 aa  63.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28240  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  26.18 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3890  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.3 
 
 
711 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0297605  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.22 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.89 
 
 
260 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.27 
 
 
257 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
270 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5263  hypothetical protein  29.41 
 
 
223 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  29.17 
 
 
262 aa  63.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.71 
 
 
260 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.18 
 
 
259 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_004310  BR2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.6 
 
 
258 aa  62.4  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577666  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.02 
 
 
260 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  27.73 
 
 
262 aa  62  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  26.47 
 
 
268 aa  62  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  29.49 
 
 
260 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 
270 aa  62  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.403885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5442  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.53 
 
 
692 aa  62  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.04 
 
 
259 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2067  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  26.76 
 
 
654 aa  61.6  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2946  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.27 
 
 
220 aa  61.6  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000350804  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  26.77 
 
 
258 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.42 
 
 
262 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1480  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.87 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857901  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.89 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  26.77 
 
 
258 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  26.77 
 
 
258 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4259  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.48 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.88 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  28.81 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  26.77 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1376  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 
259 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>