More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28240 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_28240  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  100 
 
 
220 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.47 
 
 
225 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5263  hypothetical protein  59.26 
 
 
223 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1544  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  57.8 
 
 
223 aa  256  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2452  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.02 
 
 
223 aa  254  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2946  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.55 
 
 
220 aa  234  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000350804  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.18 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0984  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.79 
 
 
236 aa  176  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1789  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.75 
 
 
235 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.62 
 
 
236 aa  142  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00829683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4460  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
268 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.95 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000198349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01710  putative enoyl-CoA hydratase  33.8 
 
 
238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104358  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06767  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G14850)  31.98 
 
 
244 aa  106  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.761527  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06210  conserved hypothetical protein  31 
 
 
266 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.64 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.19 
 
 
248 aa  81.6  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.18 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4911  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.348513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0225  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.78 
 
 
253 aa  75.1  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  35.84 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.13 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.07 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  36.14 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  35.84 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  36.14 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0754  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.43 
 
 
695 aa  73.2  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  36.14 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  35.84 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  35.84 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  35.84 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.14 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.69 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  36.14 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  36.14 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  36.14 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.76 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.59 
 
 
255 aa  72  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3901  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  34.65 
 
 
729 aa  72  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.29 
 
 
261 aa  71.6  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2100  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  26.2 
 
 
719 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.937609  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  36.14 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  34.18 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  33.94 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3747  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.21 
 
 
730 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  27.49 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  29.68 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  28.04 
 
 
651 aa  70.5  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6508  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.451547  normal  0.193137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.67 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  30.59 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  30.59 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  30.59 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  30.59 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  30.59 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  30.59 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  36.14 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  30.59 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  36.14 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1934  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  26.55 
 
 
719 aa  68.9  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.615527 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0459  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  26.92 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0044  short chain enoyl-CoA hydratase  35.85 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535261  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  29.02 
 
 
261 aa  68.6  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10643  enoyl-CoA hydratase  29.63 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000313119  normal  0.0554136 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1216  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  26.92 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2611  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  26.92 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.285185  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1382  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  26.92 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.465754  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1116  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  26.92 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0703433  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1468  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  26.92 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0875156  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0183  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  26.92 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.260328  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0094  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.53 
 
 
255 aa  68.2  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0173  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.3 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00691554 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  28.72 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2227  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  26.55 
 
 
719 aa  67.8  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.157298 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02638  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  24.12 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1739  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.97 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  26.83 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5229  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.52 
 
 
277 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  27.14 
 
 
275 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0015  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.42 
 
 
716 aa  67  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000759827  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0164  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.2 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  29.72 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3423  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  28.92 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  26.67 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  28.86 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  30.6 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.35 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  34.94 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.89 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  29.94 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0650  putative crotonase  27.09 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.63 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258792  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.26 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>