More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0984 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0984  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
236 aa  478  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1789  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.6 
 
 
235 aa  244  6e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1544  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  52.05 
 
 
223 aa  211  7e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2946  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.32 
 
 
220 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000350804  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5263  hypothetical protein  48.67 
 
 
223 aa  204  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.12 
 
 
225 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2452  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.43 
 
 
223 aa  200  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28240  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  47.79 
 
 
220 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.9 
 
 
225 aa  189  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.86 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00829683  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01710  putative enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104358  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4460  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.35 
 
 
268 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
238 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000198349  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06210  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 
266 aa  88.6  7e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.11 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06767  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G14850)  28.98 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.761527  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0164  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.24 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  30.69 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2878  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.97 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.28 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.04 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  36.56 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0754  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.84 
 
 
695 aa  64.7  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  35.71 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  35.71 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  35.71 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  35.71 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  35.71 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  35 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  35.97 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  27.62 
 
 
259 aa  63.5  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0173  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.69 
 
 
247 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00691554 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0826  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  30.5 
 
 
672 aa  63.5  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.18 
 
 
260 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  32.45 
 
 
258 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4116  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  30.26 
 
 
276 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.42 
 
 
260 aa  62.8  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3423  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  33.14 
 
 
260 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0015  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.65 
 
 
716 aa  63.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000759827  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14440  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.84 
 
 
715 aa  62.4  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.308219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1789  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
261 aa  62  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2036  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.11 
 
 
257 aa  62  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4941  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.31 
 
 
249 aa  61.6  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.253569  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1744  enoyl-CoA hydratase  30.05 
 
 
229 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216387  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2074  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.82 
 
 
258 aa  62  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1430  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.19 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0018  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  30.95 
 
 
717 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2100  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  24.87 
 
 
719 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.937609  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  31.25 
 
 
263 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.81 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.8 
 
 
267 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.87 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  27.78 
 
 
257 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.98 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1748  short chain enoyl-CoA hydratase  29.24 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.455491  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.17 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0225  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.26 
 
 
253 aa  59.7  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  28.99 
 
 
280 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1739  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.15 
 
 
242 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.34 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4679  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.18 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  32.99 
 
 
254 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3908  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.09 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03736  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  31.29 
 
 
716 aa  59.7  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
265 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2045  enoyl-CoA hydratase  27.59 
 
 
230 aa  59.7  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0655  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.45 
 
 
261 aa  59.7  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.71 
 
 
267 aa  59.7  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04036  hypothetical protein  31.02 
 
 
260 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.13651  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2974  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.25 
 
 
726 aa  59.3  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4743  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.87 
 
 
258 aa  59.3  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0219065  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.5 
 
 
257 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2227  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  25.77 
 
 
719 aa  59.3  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.157298 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4452  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.02 
 
 
258 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202133  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04074  conserved hypothetical protein  31.02 
 
 
258 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.68 
 
 
265 aa  58.9  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3804  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.02 
 
 
258 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.482495 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1934  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  25.77 
 
 
719 aa  58.9  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.615527 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4769  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.02 
 
 
258 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00226871  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  33.8 
 
 
261 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  33.1 
 
 
261 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  27.92 
 
 
662 aa  58.9  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  33.1 
 
 
261 aa  58.9  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1879  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
251 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0749  enoyl-CoA hydratase  28.64 
 
 
245 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.102863 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.23 
 
 
254 aa  58.5  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  33.1 
 
 
261 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0721  enoyl-CoA hydratase  28.64 
 
 
245 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000678732  hitchhiker  0.00168791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.56 
 
 
265 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3240  enoyl-CoA hydratase  28.64 
 
 
245 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596711  hitchhiker  0.0000100182 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.56 
 
 
265 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26 
 
 
257 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2526  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.92 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2453  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  28.24 
 
 
702 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889679  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2829  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.88 
 
 
265 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.27 
 
 
651 aa  57.8  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>