More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2074 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2074  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
258 aa  496  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2564  enoyl-CoA hydratase  53.49 
 
 
269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143328  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5132  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.8 
 
 
269 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3299  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.85 
 
 
255 aa  224  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.531306  hitchhiker  0.00131508 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1959  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.76 
 
 
292 aa  222  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3072  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.85 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.381381  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5970  enoyl-CoA hydratase  51.2 
 
 
269 aa  218  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3858  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.09 
 
 
252 aa  217  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404087  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2240  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.67 
 
 
261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000268754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2273  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.83 
 
 
313 aa  195  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1878  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
275 aa  191  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000732842  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2800  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.45 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0843636  normal  0.089031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2291  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.5 
 
 
275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00551707  hitchhiker  0.00717197 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1538  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.57 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  40.3 
 
 
659 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  36.63 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.85 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.62 
 
 
252 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.46 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.32 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  37.81 
 
 
661 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  38.05 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.83 
 
 
662 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.15 
 
 
662 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  38.66 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  34.68 
 
 
261 aa  113  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.16 
 
 
263 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.5 
 
 
262 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
262 aa  112  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.21 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.29 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.2 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.18 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.14 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.51 
 
 
257 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50 
 
 
278 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0754  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  38.42 
 
 
695 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0476  enoyl-CoA hydratase  34.23 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.21 
 
 
279 aa  109  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.17 
 
 
259 aa  109  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 
257 aa  108  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  34.7 
 
 
280 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
266 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.03 
 
 
256 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0450  enoyl-CoA hydratase  32.52 
 
 
258 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.89 
 
 
260 aa  107  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  37.61 
 
 
263 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  35.19 
 
 
268 aa  107  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.19 
 
 
259 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.44 
 
 
258 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.43 
 
 
259 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.09 
 
 
260 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.71 
 
 
257 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 
260 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  34.25 
 
 
280 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
259 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.45 
 
 
259 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.22 
 
 
266 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  34.78 
 
 
265 aa  106  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  36.95 
 
 
257 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.86 
 
 
257 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  34.42 
 
 
270 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  39.51 
 
 
251 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  34.93 
 
 
259 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1006  enoyl-CoA hydratase  43.88 
 
 
254 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.451958 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  34.23 
 
 
254 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0367  enoyl-CoA hydratase  33.78 
 
 
254 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0996  enoyl-CoA hydratase  43.88 
 
 
254 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0978  enoyl-CoA hydratase  43.88 
 
 
254 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.83 
 
 
662 aa  105  7e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.62 
 
 
259 aa  105  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  40.96 
 
 
259 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.44 
 
 
267 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.2 
 
 
259 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  36.1 
 
 
260 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00780  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.57 
 
 
260 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0697189  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  36.46 
 
 
275 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
260 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 
259 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  37.17 
 
 
663 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.37 
 
 
261 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.29 
 
 
258 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  35.79 
 
 
270 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.1 
 
 
265 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  36.03 
 
 
266 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 
299 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
274 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.11 
 
 
260 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
270 aa  102  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  41.44 
 
 
266 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  42.27 
 
 
260 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  35.78 
 
 
262 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.13 
 
 
260 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  39.05 
 
 
263 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  36.11 
 
 
258 aa  102  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 
257 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.5 
 
 
270 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.28 
 
 
261 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  36.41 
 
 
263 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>