More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3299 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3299  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
255 aa  502  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.531306  hitchhiker  0.00131508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3072  enoyl-CoA hydratase/isomerase  89.8 
 
 
255 aa  437  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.381381  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1959  enoyl-CoA hydratase/isomerase  61.22 
 
 
292 aa  271  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3858  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.57 
 
 
252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404087  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2564  enoyl-CoA hydratase  57.6 
 
 
269 aa  258  6e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5970  enoyl-CoA hydratase  56.92 
 
 
269 aa  258  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2273  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.03 
 
 
313 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2074  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.85 
 
 
258 aa  223  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2240  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.84 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000268754  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5132  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.16 
 
 
269 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2800  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.4 
 
 
279 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0843636  normal  0.089031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1878  enoyl-CoA hydratase  48.81 
 
 
275 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000732842  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2291  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.38 
 
 
275 aa  192  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00551707  hitchhiker  0.00717197 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  41.84 
 
 
659 aa  138  8.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  43.44 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.63 
 
 
262 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.86 
 
 
259 aa  125  9e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 
257 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  41.79 
 
 
661 aa  122  5e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1538  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.97 
 
 
255 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.68 
 
 
278 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.78 
 
 
261 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.76 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.07 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.44 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.38 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.86 
 
 
257 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.05 
 
 
662 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.64 
 
 
662 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3662  short chain enoyl-CoA hydratase  38.34 
 
 
258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.745999  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.06 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.07 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.46 
 
 
260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.11 
 
 
269 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.47 
 
 
257 aa  113  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.68 
 
 
258 aa  112  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.88 
 
 
260 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 
260 aa  112  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.09 
 
 
257 aa  112  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.79 
 
 
257 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  37.04 
 
 
257 aa  111  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.7 
 
 
662 aa  111  9e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 
259 aa  111  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  41.29 
 
 
270 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.97 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  37.57 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.67 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.82 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1857  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.91 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.172746  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1675  enoyl-CoA hydratase  40.09 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237692  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.27 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.75 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.92 
 
 
265 aa  109  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  37.06 
 
 
257 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.22 
 
 
258 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.51 
 
 
253 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  35.12 
 
 
277 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.11 
 
 
260 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0682  short chain enoyl-CoA hydratase  41.45 
 
 
285 aa  109  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
257 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  36.18 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  36.18 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.95 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  36.18 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  36.18 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  36.18 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  36.18 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  36.18 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.44 
 
 
254 aa  109  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  37.43 
 
 
251 aa  108  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.05 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.42 
 
 
267 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  33.5 
 
 
257 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  33.5 
 
 
257 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  33.5 
 
 
257 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  36.17 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  36.56 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 
258 aa  108  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.21 
 
 
264 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  34.45 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4369  enoyl-CoA hydratase  35.48 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0156166 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  36.17 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  36.18 
 
 
258 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.46 
 
 
258 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  37.43 
 
 
262 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.49 
 
 
251 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 
257 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 
260 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  39.78 
 
 
257 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3977  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.98 
 
 
236 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  34.9 
 
 
258 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
256 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 
259 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.27 
 
 
264 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  35.9 
 
 
260 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>