More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5132 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5132  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
269 aa  516  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2564  enoyl-CoA hydratase  54.75 
 
 
269 aa  263  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143328  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2074  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.8 
 
 
258 aa  230  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3072  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.95 
 
 
255 aa  221  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.381381  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3858  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.47 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404087  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3299  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.95 
 
 
255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.531306  hitchhiker  0.00131508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5970  enoyl-CoA hydratase  51.97 
 
 
269 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2800  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.4 
 
 
279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0843636  normal  0.089031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1878  enoyl-CoA hydratase  48.69 
 
 
275 aa  206  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000732842  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1959  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.61 
 
 
292 aa  206  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2240  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.19 
 
 
261 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000268754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2273  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.98 
 
 
313 aa  188  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2291  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.54 
 
 
275 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00551707  hitchhiker  0.00717197 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  37.69 
 
 
659 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  41.58 
 
 
661 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.19 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.89 
 
 
662 aa  115  5e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.67 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.97 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1538  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.1 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.68 
 
 
259 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.68 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.86 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.39 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.84 
 
 
662 aa  112  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.85 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0672  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.89 
 
 
662 aa  110  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.56 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  37.88 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
267 aa  108  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  33.64 
 
 
258 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.54 
 
 
257 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.31 
 
 
251 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 
264 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.5 
 
 
265 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.94 
 
 
261 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
267 aa  106  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.63 
 
 
264 aa  106  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  41.62 
 
 
266 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.41 
 
 
258 aa  106  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  37.63 
 
 
268 aa  106  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.53 
 
 
262 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  36.07 
 
 
261 aa  106  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 
260 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  36.59 
 
 
257 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 
258 aa  106  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.85 
 
 
265 aa  105  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.93 
 
 
266 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31062  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.56 
 
 
258 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  35.47 
 
 
257 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.48 
 
 
257 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.32 
 
 
266 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1316  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.96 
 
 
260 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.200035  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.78 
 
 
258 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.24 
 
 
252 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.61 
 
 
257 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.82 
 
 
269 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.84 
 
 
276 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.13 
 
 
262 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.38 
 
 
260 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
265 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  38.38 
 
 
258 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
257 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5229  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.62 
 
 
277 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.2 
 
 
273 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.79 
 
 
266 aa  103  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.1 
 
 
256 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 
274 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 
265 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.95 
 
 
260 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  34.81 
 
 
258 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.75 
 
 
259 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.9 
 
 
256 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.27 
 
 
260 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  39.06 
 
 
251 aa  102  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  34.81 
 
 
258 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  36.9 
 
 
260 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.51 
 
 
260 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.87 
 
 
265 aa  102  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  36.03 
 
 
262 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
264 aa  102  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
257 aa  102  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  33.81 
 
 
265 aa  102  8e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  37.13 
 
 
266 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
269 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.72 
 
 
253 aa  101  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37 
 
 
261 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  37.35 
 
 
264 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  37.37 
 
 
258 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  36.55 
 
 
266 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.66 
 
 
279 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.37 
 
 
258 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  38.15 
 
 
277 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1825  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
261 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0326098  normal  0.27038 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.67 
 
 
259 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1319  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.85 
 
 
266 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  37.75 
 
 
277 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>