More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2564 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2564  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
269 aa  529  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5970  enoyl-CoA hydratase  55.91 
 
 
269 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1959  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.6 
 
 
292 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2273  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.09 
 
 
313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3299  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.6 
 
 
255 aa  245  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.531306  hitchhiker  0.00131508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3072  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.37 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.381381  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5132  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.75 
 
 
269 aa  241  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2240  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.9 
 
 
261 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000268754  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2800  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.69 
 
 
279 aa  229  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0843636  normal  0.089031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1878  enoyl-CoA hydratase  50.58 
 
 
275 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000732842  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3858  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.2 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404087  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2074  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.37 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2291  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.56 
 
 
275 aa  199  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00551707  hitchhiker  0.00717197 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.73 
 
 
265 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.79 
 
 
259 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.37 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  32.94 
 
 
257 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.81 
 
 
264 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0281  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.34 
 
 
265 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11671  normal  0.186449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0240  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.54 
 
 
265 aa  105  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.480745 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1538  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.07 
 
 
255 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32 
 
 
258 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.65 
 
 
251 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.17 
 
 
659 aa  104  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.15 
 
 
263 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.41 
 
 
258 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.71 
 
 
278 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.78 
 
 
259 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  32.9 
 
 
257 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 
260 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.08 
 
 
267 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  32.88 
 
 
259 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.88 
 
 
258 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.68 
 
 
269 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 
280 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.98 
 
 
260 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  33.61 
 
 
258 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.46 
 
 
259 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.78 
 
 
262 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0268  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.06 
 
 
261 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.21713  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.27 
 
 
661 aa  100  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.17 
 
 
252 aa  100  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.35 
 
 
259 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2758  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  28.88 
 
 
279 aa  99.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.154422  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  37.37 
 
 
260 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.63 
 
 
662 aa  99.4  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.3 
 
 
259 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.86 
 
 
270 aa  99  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
253 aa  99  7e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  34.85 
 
 
257 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  37.04 
 
 
260 aa  99  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.62 
 
 
267 aa  99  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
287 aa  99  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  32.37 
 
 
270 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0804  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
261 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0540  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
261 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0469  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
261 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2054  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
261 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577425  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1606  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
261 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.7 
 
 
259 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0652  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
261 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.572722  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1957  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
261 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  30.38 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1464  enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.2 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.04 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  33.62 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 
275 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.35 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
264 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4421  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.16 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  32.35 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.58 
 
 
259 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  32.78 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  36.44 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.61 
 
 
257 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  31.51 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.76 
 
 
264 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.61 
 
 
257 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.42 
 
 
662 aa  97.1  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.61 
 
 
257 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.74 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31062  normal  0.506676 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.12 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1319  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.74 
 
 
266 aa  96.3  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 
257 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 
260 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 
264 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5223  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  33.84 
 
 
276 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136536  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5636  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  33.84 
 
 
276 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603741  decreased coverage  0.00134982 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.38 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1857  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.07 
 
 
270 aa  96.7  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.172746  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  30.84 
 
 
270 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 
264 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2749  enoyl-CoA hydratase  32.77 
 
 
258 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000689883  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 
279 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3078  short chain enoyl-CoA hydratase  32.26 
 
 
258 aa  96.3  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13392  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.21 
 
 
257 aa  95.9  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.28043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>