More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2291 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2291  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
275 aa  536  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00551707  hitchhiker  0.00717197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2564  enoyl-CoA hydratase  55.92 
 
 
269 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5970  enoyl-CoA hydratase  51.61 
 
 
269 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3299  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.38 
 
 
255 aa  221  7e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.531306  hitchhiker  0.00131508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3072  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.74 
 
 
255 aa  218  7e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.381381  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1959  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.82 
 
 
292 aa  215  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3858  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.81 
 
 
252 aa  214  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404087  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5132  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.76 
 
 
269 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2074  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.82 
 
 
258 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2273  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.84 
 
 
313 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1878  enoyl-CoA hydratase  45.98 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000732842  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2800  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.11 
 
 
279 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0843636  normal  0.089031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2240  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.15 
 
 
261 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000268754  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.18 
 
 
662 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.03 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.07 
 
 
661 aa  110  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.6 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  32.07 
 
 
257 aa  109  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 
264 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.84 
 
 
265 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.18 
 
 
662 aa  106  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.58 
 
 
267 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  34.48 
 
 
260 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.32 
 
 
651 aa  102  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  30.83 
 
 
257 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  30.83 
 
 
257 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  30.83 
 
 
257 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.42 
 
 
278 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.5 
 
 
280 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  36.21 
 
 
261 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.08 
 
 
659 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  36.21 
 
 
261 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  36.21 
 
 
261 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  36.21 
 
 
261 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0814  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.88 
 
 
262 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134124  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.23 
 
 
662 aa  100  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.97 
 
 
254 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.93 
 
 
258 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  36.21 
 
 
261 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.91 
 
 
258 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.63 
 
 
259 aa  100  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.57 
 
 
258 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
258 aa  100  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  29.58 
 
 
258 aa  99.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.49 
 
 
257 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  31.06 
 
 
257 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1845  enoyl-CoA hydratase  37.04 
 
 
259 aa  99.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068213  decreased coverage  0.00498054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.49 
 
 
257 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.49 
 
 
257 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
262 aa  99.4  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  31.49 
 
 
257 aa  99  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.13 
 
 
269 aa  99  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.04 
 
 
268 aa  99  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.02 
 
 
267 aa  98.6  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.51 
 
 
258 aa  98.6  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.68 
 
 
260 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.73 
 
 
262 aa  97.8  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0774  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.14 
 
 
254 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.730514  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  31.49 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  30.54 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  38.43 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.76 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.4 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.6 
 
 
259 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.88 
 
 
259 aa  96.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.58 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.06 
 
 
257 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  35.86 
 
 
261 aa  96.7  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.49 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2758  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  28.63 
 
 
279 aa  96.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.154422  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.66 
 
 
258 aa  96.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 
258 aa  96.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  34.6 
 
 
297 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.85 
 
 
260 aa  96.3  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 
259 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.47 
 
 
260 aa  95.9  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  34.65 
 
 
259 aa  95.9  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.75 
 
 
257 aa  95.9  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  34.91 
 
 
261 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  32.24 
 
 
263 aa  95.5  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0166  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.33 
 
 
249 aa  95.5  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.98 
 
 
258 aa  95.5  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0941  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
257 aa  95.5  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 
261 aa  95.5  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
259 aa  95.5  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  34.91 
 
 
297 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.92 
 
 
663 aa  95.1  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  31.12 
 
 
261 aa  95.1  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28460  short chain enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528871  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  34.91 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  34.91 
 
 
297 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.59 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
265 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2169  enoyl-CoA hydratase  35.8 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.086116  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.16 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  35.81 
 
 
273 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  33.76 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>