More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3858 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3858  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
252 aa  493  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404087  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3299  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.57 
 
 
255 aa  249  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.531306  hitchhiker  0.00131508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3072  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.65 
 
 
255 aa  246  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.381381  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1959  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.09 
 
 
292 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5970  enoyl-CoA hydratase  51.63 
 
 
269 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2564  enoyl-CoA hydratase  50.2 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143328  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2240  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.17 
 
 
261 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000268754  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2074  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.09 
 
 
258 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1878  enoyl-CoA hydratase  50.41 
 
 
275 aa  205  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000732842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5132  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.23 
 
 
269 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2273  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.62 
 
 
313 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2800  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.08 
 
 
279 aa  192  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0843636  normal  0.089031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2291  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.81 
 
 
275 aa  176  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00551707  hitchhiker  0.00717197 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  39.73 
 
 
659 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 
267 aa  118  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5093  enoyl-CoA hydratase  37.69 
 
 
263 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382387 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.21 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.44 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.02 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.44 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  34.58 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.44 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0384  short chain enoyl-CoA hydratase  41.24 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.18 
 
 
259 aa  113  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.81 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  35.2 
 
 
261 aa  112  5e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.77 
 
 
252 aa  112  6e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  32.53 
 
 
258 aa  112  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
257 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
257 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
257 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  33.73 
 
 
257 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.82 
 
 
278 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.75 
 
 
257 aa  111  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.89 
 
 
263 aa  111  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  37.85 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  37.85 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.97 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.05 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.02 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  35.89 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1376  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.77 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0682  short chain enoyl-CoA hydratase  46.94 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.82 
 
 
264 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.84 
 
 
264 aa  109  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  37.63 
 
 
661 aa  110  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.38 
 
 
256 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.42 
 
 
257 aa  109  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.41 
 
 
259 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  37.81 
 
 
260 aa  108  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.75 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.05 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.3 
 
 
262 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
258 aa  108  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 
265 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.43 
 
 
258 aa  108  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  34.65 
 
 
257 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.236024  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.38 
 
 
258 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3977  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.17 
 
 
236 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.44 
 
 
259 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203643  normal  0.505075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1480  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.77 
 
 
259 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857901  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.64 
 
 
259 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.010448  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
265 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 
257 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.91 
 
 
273 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.54 
 
 
265 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.14 
 
 
257 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  33.05 
 
 
260 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.23 
 
 
260 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.98 
 
 
270 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.07 
 
 
256 aa  106  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38 
 
 
257 aa  105  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  38.73 
 
 
273 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  38.73 
 
 
273 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 
257 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
259 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  31.08 
 
 
258 aa  105  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  36.22 
 
 
260 aa  105  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.91 
 
 
261 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.45 
 
 
259 aa  105  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0814  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.52 
 
 
262 aa  105  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134124  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
261 aa  105  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.91 
 
 
254 aa  105  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.98 
 
 
259 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.95 
 
 
278 aa  105  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
263 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.58 
 
 
266 aa  104  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 
257 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  35.51 
 
 
257 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0897  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.05 
 
 
265 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  33.67 
 
 
262 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.11 
 
 
258 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.74 
 
 
259 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
263 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1778  enoyl-CoA hydratase  38.03 
 
 
259 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.3 
 
 
662 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>