More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1959 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1959  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
292 aa  574  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5970  enoyl-CoA hydratase  71.31 
 
 
269 aa  354  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2240  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.31 
 
 
261 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000268754  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1878  enoyl-CoA hydratase  57.85 
 
 
275 aa  265  8e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000732842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2564  enoyl-CoA hydratase  55.6 
 
 
269 aa  258  6e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143328  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3299  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.98 
 
 
255 aa  257  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.531306  hitchhiker  0.00131508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3072  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.16 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.381381  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2800  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.57 
 
 
279 aa  235  8e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0843636  normal  0.089031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3858  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.09 
 
 
252 aa  232  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404087  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2273  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.44 
 
 
313 aa  228  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2074  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.76 
 
 
258 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5132  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51 
 
 
269 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2291  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.05 
 
 
275 aa  178  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00551707  hitchhiker  0.00717197 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.85 
 
 
257 aa  125  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.89 
 
 
659 aa  124  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.61 
 
 
254 aa  116  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
263 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3358  methylglutaconyl-CoA hydratase  41.31 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  42.16 
 
 
280 aa  112  6e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0560  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
246 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
267 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.63 
 
 
278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.91 
 
 
270 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  38.26 
 
 
261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.14 
 
 
264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4765  enoyl-CoA hydratase  39.57 
 
 
260 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991647  normal  0.447028 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 
265 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  39.39 
 
 
260 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.48 
 
 
258 aa  108  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.49 
 
 
259 aa  108  9.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.12 
 
 
257 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.28043  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0248  enoyl-CoA hydratase  38.91 
 
 
262 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.4 
 
 
256 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3478  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  33.48 
 
 
283 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0451778  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 
251 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2591  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.91 
 
 
258 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000604766  decreased coverage  0.0000000224287 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.71 
 
 
661 aa  107  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 
258 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.61 
 
 
261 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
261 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2752  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.35 
 
 
260 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 
257 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 
265 aa  106  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.77 
 
 
261 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5093  enoyl-CoA hydratase  37.93 
 
 
263 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  36.13 
 
 
258 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.13 
 
 
258 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.46 
 
 
260 aa  106  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2758  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  33.33 
 
 
279 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.154422  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.41 
 
 
269 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
261 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.67 
 
 
278 aa  105  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  33.82 
 
 
258 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.63 
 
 
259 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4064  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.34 
 
 
259 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0816295  normal  0.0761616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
258 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2165  enoyl-CoA hydratase  37.34 
 
 
280 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  36.61 
 
 
258 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.71 
 
 
256 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0268  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.21 
 
 
261 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.21713  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.18 
 
 
662 aa  103  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  33.48 
 
 
257 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.84 
 
 
273 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 
258 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  33.48 
 
 
257 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  33.48 
 
 
257 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1857  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.87 
 
 
270 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.172746  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1802  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  34.33 
 
 
275 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0629  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  34.33 
 
 
275 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0837  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  34.33 
 
 
275 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.205206  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  36.32 
 
 
256 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  37.63 
 
 
273 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2361  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  33.91 
 
 
275 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597105  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1067  p-hydroxycinnamoyl CoA hydratase/lyase  33.91 
 
 
275 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.21 
 
 
259 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.76 
 
 
257 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  34.58 
 
 
263 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  34.58 
 
 
263 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  35.75 
 
 
258 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  34.58 
 
 
263 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  34.58 
 
 
263 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.91 
 
 
257 aa  102  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  34.58 
 
 
263 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  34.58 
 
 
263 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  34.58 
 
 
263 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  39.36 
 
 
268 aa  102  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0717  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.92 
 
 
258 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.11 
 
 
260 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  35.21 
 
 
277 aa  102  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  33.75 
 
 
263 aa  102  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.91 
 
 
274 aa  102  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 
275 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4733  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.31 
 
 
259 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.77 
 
 
254 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  32.64 
 
 
258 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1538  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 
255 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 
259 aa  102  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>