More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0560 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0560  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 246 aa  478  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1959  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16135  predicted protein  37.39 
 
 		 278 aa  116  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  30.42 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  30.8 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0145  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.58 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.6 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  29.92 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4708  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  34.74 
 
 		 267 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.740902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  30.33 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.52 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  30.04 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1878  enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000732842  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.29 
 
 		 267 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  32.87 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  35.39 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.17 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1507  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.4 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  33.77 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5074  enoyl-CoA hydratase  29.92 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4986  enoyl-CoA hydratase  29.92 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906298  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5367  enoyl-CoA hydratase  29.92 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.1 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.66 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  29.1 
 
 		 270 aa  101  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  30.42 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  32.24 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.45 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  32.48 
 
 		 261 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  27.53 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.33 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  28.51 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13808  enoyl-CoA hydratase  32.99 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0373672  normal  0.457515 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  34.07 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36 
 
 		 659 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  32.31 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.56 
 
 		 275 aa  99.4  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396573  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.79 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1155  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.35 
 
 		 279 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.712198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 		 265 aa  99  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.88 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  32.49 
 
 		 265 aa  98.6  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  27.87 
 
 		 270 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.67 
 
 		 271 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2240  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.89 
 
 		 261 aa  98.6  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000268754  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.69 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.16 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  34.29 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5970  enoyl-CoA hydratase  34.52 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  33.9 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2008  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.02 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  35.36 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  33.04 
 
 		 266 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.16 
 
 		 657 aa  97.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2337  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.07 
 
 		 280 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0655331  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5613  enoyl-CoA hydratase  28.74 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333814  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.51 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  32.19 
 
 		 264 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.81 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1743  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32 
 
 		 663 aa  96.3  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.987316  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  37.43 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 		 268 aa  96.3  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.48 
 
 		 262 aa  95.9  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  31.64 
 
 		 268 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  32.92 
 
 		 266 aa  95.9  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.43 
 
 		 264 aa  95.5  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.53 
 
 		 259 aa  95.9  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 		 273 aa  95.9  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2200  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 		 283 aa  95.5  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0179241  normal  0.0692381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 		 257 aa  95.1  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.16 
 
 		 274 aa  94.4  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.7 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2583  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.41 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.601041  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  30.41 
 
 		 266 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.01 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.24 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22630  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 		 287 aa  94.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  33.18 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1664  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.42 
 
 		 717 aa  94.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0455542  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.32 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.2 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1193  enoyl-CoA hydratase  28.74 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1480  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.42 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  25.86 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5886  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0569786  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  31.07 
 
 		 268 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0279  enoyl-CoA hydratase  29.36 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0330  enoyl-CoA hydratase  34.63 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150618  hitchhiker  0.00796667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>