More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3072 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3072  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
255 aa  497  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.381381  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3299  enoyl-CoA hydratase/isomerase  89.8 
 
 
255 aa  437  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.531306  hitchhiker  0.00131508 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1959  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.41 
 
 
292 aa  268  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5970  enoyl-CoA hydratase  57.71 
 
 
269 aa  262  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2564  enoyl-CoA hydratase  57.37 
 
 
269 aa  257  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143328  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3858  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.65 
 
 
252 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404087  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2273  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.43 
 
 
313 aa  240  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2074  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.85 
 
 
258 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2240  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.22 
 
 
261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000268754  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5132  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.9 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2800  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.92 
 
 
279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0843636  normal  0.089031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1878  enoyl-CoA hydratase  48.22 
 
 
275 aa  191  9e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000732842  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2291  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.56 
 
 
275 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00551707  hitchhiker  0.00717197 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  40.51 
 
 
659 aa  132  7.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  41.44 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  41.21 
 
 
661 aa  125  5e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.94 
 
 
262 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1538  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.97 
 
 
255 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.86 
 
 
257 aa  122  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.5 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  33.76 
 
 
257 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.16 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.82 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3662  short chain enoyl-CoA hydratase  40.21 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.745999  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.46 
 
 
270 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.27 
 
 
257 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.49 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.54 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.18 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.82 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  34.66 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.37 
 
 
258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.79 
 
 
262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.76 
 
 
662 aa  112  5e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.2 
 
 
662 aa  112  5e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.45 
 
 
261 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.17 
 
 
258 aa  111  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.46 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  40.4 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.65 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1492  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.11 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.992582  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  34.05 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4606  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.47 
 
 
257 aa  109  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  32.22 
 
 
258 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.62 
 
 
260 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  33.18 
 
 
269 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 
259 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  36.51 
 
 
268 aa  110  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.79 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000372  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.61 
 
 
258 aa  109  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.616977  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
256 aa  109  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2115  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.91 
 
 
254 aa  109  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.22 
 
 
967 aa  109  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  36.28 
 
 
267 aa  108  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  40.51 
 
 
270 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.54 
 
 
251 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  33.02 
 
 
260 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.83 
 
 
662 aa  108  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.03 
 
 
259 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
265 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5229  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.46 
 
 
277 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 
260 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3977  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 
236 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 
260 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2866  short chain enoyl-CoA hydratase  35.03 
 
 
257 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18512  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2835  putative enoyl-CoA hydratase  36.86 
 
 
261 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15140  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  34.42 
 
 
257 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144645  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
273 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  35 
 
 
259 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1857  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.41 
 
 
270 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.172746  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  34.44 
 
 
258 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.54 
 
 
259 aa  106  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 
259 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1675  enoyl-CoA hydratase  40.44 
 
 
273 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237692  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.91 
 
 
269 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  39.06 
 
 
256 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3232  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.8 
 
 
274 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0265787  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01705  enoyl-CoA hydratase  39.49 
 
 
265 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.834387  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  40.11 
 
 
257 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  34.98 
 
 
257 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.27 
 
 
258 aa  106  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  35.03 
 
 
277 aa  106  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.87 
 
 
259 aa  106  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
258 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  41.62 
 
 
266 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1738  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.91 
 
 
259 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0269497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.14 
 
 
267 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.22 
 
 
267 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>