More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1675 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1675  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
273 aa  511  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237692  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.57 
 
 
278 aa  122  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3299  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.26 
 
 
255 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.531306  hitchhiker  0.00131508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3858  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.11 
 
 
252 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404087  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3072  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.59 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.381381  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1959  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.62 
 
 
292 aa  92  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5970  enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 
269 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.128598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2074  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.75 
 
 
258 aa  90.1  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2564  enoyl-CoA hydratase  32.33 
 
 
269 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143328  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2291  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.79 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00551707  hitchhiker  0.00717197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2240  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000268754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2273  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.46 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.57 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2522  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.218751  normal  0.701795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4136  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.37 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5132  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.58 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  39.64 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2128  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.32 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00663938 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.95 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.27 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  42.39 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.62 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.58 
 
 
267 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.14 
 
 
264 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.96 
 
 
262 aa  62.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.82 
 
 
260 aa  62.4  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2800  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.14 
 
 
279 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0843636  normal  0.089031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  30.56 
 
 
258 aa  62.4  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  35.14 
 
 
266 aa  62.4  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.78 
 
 
281 aa  62.4  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 
265 aa  62  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  42.5 
 
 
260 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  38 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1857  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.14 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.172746  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1878  enoyl-CoA hydratase  37.88 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000732842  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  36.27 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.84 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2188  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
255 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.000498969  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1036  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.21 
 
 
258 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.14 
 
 
257 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 
257 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.14 
 
 
257 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
257 aa  59.7  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.31 
 
 
661 aa  59.3  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3498  enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
271 aa  59.3  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
257 aa  59.7  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  31.51 
 
 
257 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  31.51 
 
 
257 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1190  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
258 aa  59.3  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  31.51 
 
 
257 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  37.08 
 
 
276 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 
258 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0941  enoyl-CoA hydratase  50.68 
 
 
257 aa  58.9  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  37.08 
 
 
281 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  37.08 
 
 
281 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
257 aa  58.9  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.33 
 
 
261 aa  58.9  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  38.75 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.9 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.25 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2552  enoyl-CoA hydratase  38.75 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.53 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2374  enoyl-CoA hydratase  38.75 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.91 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.29 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.1 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  29.66 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2551  enoyl-CoA hydratase  38.75 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  38.75 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  28.88 
 
 
659 aa  58.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0332  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.07 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1444  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  35 
 
 
727 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27360  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.826772  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4094  enoyl-CoA hydratase  45.21 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2564  enoyl-CoA hydratase  38.75 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45986e-17 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.11 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  46.91 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2821  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  42.53 
 
 
727 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2331  enoyl-CoA hydratase  38.75 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2290  enoyl-CoA hydratase  38.75 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  38.75 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4479  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.87 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.89 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32890  enoyl-CoA hydratase  38.53 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0620133  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0281  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.24 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11671  normal  0.186449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1663  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
367 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3078  short chain enoyl-CoA hydratase  39.73 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13392  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  33.02 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  47.44 
 
 
260 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>