More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3474 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
225 aa  448  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28240  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  63.47 
 
 
220 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5263  hypothetical protein  57.6 
 
 
223 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1544  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  53.46 
 
 
223 aa  236  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.05 
 
 
225 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2452  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.92 
 
 
223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2946  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.24 
 
 
220 aa  225  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000350804  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0984  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.9 
 
 
236 aa  169  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1789  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.58 
 
 
235 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 
236 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00829683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4460  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.51 
 
 
268 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01710  putative enoyl-CoA hydratase  41.28 
 
 
238 aa  135  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.91 
 
 
238 aa  129  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000198349  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06767  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G14850)  33.33 
 
 
244 aa  103  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.761527  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06210  conserved hypothetical protein  31.94 
 
 
266 aa  101  8e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.19 
 
 
248 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0225  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.18 
 
 
253 aa  92.4  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  29.17 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.59 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  31.63 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10643  enoyl-CoA hydratase  31.51 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000313119  normal  0.0554136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1454  enoyl-CoA hydratase  33.7 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  28.91 
 
 
275 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5267  enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2982  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  35.71 
 
 
687 aa  76.6  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0217709  normal  0.0895723 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0754  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.02 
 
 
695 aa  75.9  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.84 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.5 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2282  enoyl-CoA hydratase  31.79 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.73 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4083  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.18 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.87 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3901  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.22 
 
 
729 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  35.08 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1845  enoyl-CoA hydratase  33.7 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429815  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1744  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216387  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.08 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01709  fatty oxidation complex alpha subunit  33.33 
 
 
693 aa  73.2  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  29.61 
 
 
651 aa  73.2  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3225  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0716  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.88 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.439165  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  30.6 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.67 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.35 
 
 
262 aa  72  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  36.46 
 
 
261 aa  71.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  36.46 
 
 
261 aa  71.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  36.46 
 
 
261 aa  71.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  33.16 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  33.16 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  29.06 
 
 
275 aa  71.6  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  33.16 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  33.16 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  33.16 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  33.16 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  33.16 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  36.46 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3276  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  30.81 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1547  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  32.28 
 
 
637 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000330184  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  31.79 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  36.46 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1087  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.28 
 
 
696 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2108  enoyl-CoA hydratase  31.49 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430525  normal  0.0139564 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38470  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  30.81 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1423  enoyl-CoA hydratase  33.53 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293032  normal  0.655993 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0267  enoyl-CoA hydratase  31.46 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1875  enoyl-CoA hydratase  28.9 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4549  enoyl-CoA hydratase  34.27 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.273916  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2526  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.03 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3658  gamma-carboxygeranoyl-CoA hydratase  34.13 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.551488  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.34 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.05 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02638  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  27.87 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3752  enoyl-CoA hydratase  29.85 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.56 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  37.91 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  35.91 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.96 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2737  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.77 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03320  conserved hypothetical protein  33.83 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.868231  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3865  enoyl-CoA hydratase  32.6 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  37.91 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2834  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.33 
 
 
673 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.189846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  37.91 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0044  short chain enoyl-CoA hydratase  34.59 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3761  enoyl-CoA hydratase  29.59 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  0.940889 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1436  enoyl-CoA hydratase  27.86 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.518043  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.91 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.11 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  37.91 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.11 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53207  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.54 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  29.83 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  37.91 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1905  enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.888285  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>