More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3252 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4911  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
254 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
254 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.348513 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6508  enoyl-CoA hydratase/isomerase  92.89 
 
 
262 aa  454  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.451547  normal  0.193137 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  38.03 
 
 
255 aa  122  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  34.08 
 
 
260 aa  122  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.56 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.56 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.31 
 
 
260 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.56 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  37.43 
 
 
260 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.06 
 
 
259 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
261 aa  118  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
261 aa  115  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  32.29 
 
 
262 aa  115  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.18 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28460  short chain enoyl-CoA hydratase  37.63 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528871  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 
263 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 
263 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  31.22 
 
 
263 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 
263 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  31.22 
 
 
263 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 
263 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.52 
 
 
258 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.17 
 
 
260 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.08 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.14 
 
 
262 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.93 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.01 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0299  enoyl-CoA hydratase  33.81 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  38.58 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.38 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.21 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.57 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.87 
 
 
262 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  37.89 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  33.67 
 
 
268 aa  108  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.86 
 
 
259 aa  108  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 
265 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4093  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.64 
 
 
261 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0902  enoyl-CoA hydratase  33.01 
 
 
260 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  31.77 
 
 
258 aa  107  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.87 
 
 
261 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3199  enoyl-CoA hydratase  28.86 
 
 
257 aa  107  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00556832 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.16 
 
 
260 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  32.09 
 
 
258 aa  106  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.82 
 
 
256 aa  106  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000247495  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.35 
 
 
262 aa  105  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.5 
 
 
287 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
268 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.67 
 
 
260 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  36.21 
 
 
257 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 
260 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.1 
 
 
263 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.16 
 
 
264 aa  104  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1515  enoyl-CoA hydratase  34.64 
 
 
260 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.87 
 
 
256 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 
257 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6065  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 
259 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.638371  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  32.49 
 
 
259 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0754  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.13 
 
 
695 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000372  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.37 
 
 
258 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.616977  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  30.43 
 
 
261 aa  103  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  30.04 
 
 
261 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.03 
 
 
257 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1400  enoyl-CoA hydratase  30.35 
 
 
257 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.5 
 
 
267 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  34.92 
 
 
288 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
252 aa  102  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
260 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  33.17 
 
 
256 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.05 
 
 
261 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0341  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.1 
 
 
246 aa  102  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2191  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.11 
 
 
260 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.572895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.11 
 
 
260 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  35.16 
 
 
283 aa  102  6e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1666  short chain enoyl-CoA hydratase  33.64 
 
 
260 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2131  enoyl-CoA hydratase  30.5 
 
 
259 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.540792  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.81 
 
 
259 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.05 
 
 
260 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1476  enoyl-CoA hydratase  29.03 
 
 
257 aa  102  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0195033 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1378  enoyl-CoA hydratase  32.97 
 
 
257 aa  102  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  29.59 
 
 
275 aa  101  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2653  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  35.57 
 
 
679 aa  102  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1528  enoyl-CoA hydratase  27.6 
 
 
257 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5876  enoyl-CoA hydratase  34.31 
 
 
268 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6221  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase / short chain enoyl-CoA hydratase  35.03 
 
 
710 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368406  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1492  enoyl-CoA hydratase  27.6 
 
 
257 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0248  enoyl-CoA hydratase  35.09 
 
 
262 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2853  enoyl-CoA hydratase  27.6 
 
 
257 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000407618 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2344  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.04 
 
 
265 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 
267 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 
258 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.05 
 
 
260 aa  101  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
258 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.34 
 
 
259 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3394  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 
1823 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>