More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0587 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0587  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
229 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3560  enoyl-CoA hydratase  60.89 
 
 
229 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41950  enoyl-CoA hydratase  60.44 
 
 
229 aa  278  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2912  enoyl-CoA hydratase  57.59 
 
 
252 aa  273  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00810936  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2065  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  60 
 
 
229 aa  271  6e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898876  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1875  enoyl-CoA hydratase  59.11 
 
 
229 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2108  enoyl-CoA hydratase  57.33 
 
 
229 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430525  normal  0.0139564 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2045  enoyl-CoA hydratase  58.3 
 
 
230 aa  261  8e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1845  enoyl-CoA hydratase  55.56 
 
 
229 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429815  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1454  enoyl-CoA hydratase  57.33 
 
 
229 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2282  enoyl-CoA hydratase  56.33 
 
 
237 aa  256  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3865  enoyl-CoA hydratase  55.56 
 
 
229 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1423  enoyl-CoA hydratase  56 
 
 
229 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293032  normal  0.655993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1744  enoyl-CoA hydratase  56 
 
 
229 aa  252  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216387  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.43 
 
 
238 aa  176  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0736  enoyl-CoA hydratase  39.19 
 
 
231 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5125  enoyl-CoA hydratase  45.81 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1226  enoyl-CoA hydratase  44.93 
 
 
233 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146612  normal  0.418232 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02638  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  40.38 
 
 
218 aa  149  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10643  enoyl-CoA hydratase  36.16 
 
 
231 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000313119  normal  0.0554136 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2642  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.39 
 
 
235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  0.778271 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0918  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0911  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0928  enoyl-CoA hydratase  38.67 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0225  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.05 
 
 
253 aa  99.8  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.72 
 
 
258 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.58 
 
 
248 aa  82  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.51 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.67 
 
 
262 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
265 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1968  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  28.96 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.503691  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5442  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  27.51 
 
 
692 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  30.71 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0145  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.27 
 
 
268 aa  71.6  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18064  predicted protein  28.39 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.73 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  27.39 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2522  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.86 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.218751  normal  0.701795 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0754  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.48 
 
 
695 aa  68.6  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.14 
 
 
259 aa  68.2  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.25 
 
 
258 aa  68.2  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0094  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.14 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  26.09 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.17 
 
 
262 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4689  enoyl-CoA hydratase  29.91 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552006  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.14 
 
 
266 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4819  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
263 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.69 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.13 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  26.52 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.06 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4309  enoyl-CoA hydratase  29.46 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.979259  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  30 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4395  enoyl-CoA hydratase  29.46 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.51 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258792  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.9 
 
 
248 aa  65.1  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  27.13 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.23 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4851  enoyl-CoA hydratase  29.61 
 
 
273 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2522  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.72 
 
 
257 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1880  enoyl-CoA hydratase  36.62 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0910534 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.37 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000247495  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1739  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.13 
 
 
242 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0737  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.18 
 
 
263 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4093  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.44 
 
 
261 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.34 
 
 
260 aa  62.8  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0436  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.92 
 
 
725 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0845  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  28.78 
 
 
687 aa  62.4  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.13 
 
 
259 aa  62.4  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1480  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.83 
 
 
259 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857901  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  25.62 
 
 
259 aa  62.4  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.32 
 
 
260 aa  62  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0437  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.29 
 
 
725 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  27.2 
 
 
257 aa  61.6  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.010448  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.61 
 
 
661 aa  61.2  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1376  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.18 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.16 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2430  enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 
262 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.86 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.97 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4532  enoyl-CoA hydratase  26.73 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.32 
 
 
262 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0655  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.75 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  24.02 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  24.02 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1011  enoyl-CoA hydratase  30.39 
 
 
295 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2878  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.03 
 
 
260 aa  60.5  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  26.64 
 
 
257 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.01 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0071566  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.26 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1748  short chain enoyl-CoA hydratase  26.96 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.455491  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.19 
 
 
263 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  30.99 
 
 
257 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5201  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.79 
 
 
257 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492182  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3671  short chain enoyl-CoA hydratase  33.13 
 
 
256 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.120291  normal  0.634678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3658  short chain enoyl-CoA hydratase  29 
 
 
238 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.25 
 
 
659 aa  60.1  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3731  short chain enoyl-CoA hydratase  29 
 
 
238 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0234  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  28.57 
 
 
691 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00586824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>