More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2703 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_2703  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
268 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41088  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1123  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.61 
 
 
268 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0897  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.03 
 
 
265 aa  254  7e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0045  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39 
 
 
256 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.08 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1936  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.03 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.74 
 
 
260 aa  132  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  30.74 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 
259 aa  130  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  32.05 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.8 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 
260 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1484  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.95 
 
 
260 aa  125  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
263 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 
269 aa  122  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1663  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.57 
 
 
367 aa  122  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  27.34 
 
 
262 aa  122  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.39 
 
 
661 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  32.09 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  31.78 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.17 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.28 
 
 
662 aa  120  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.71 
 
 
662 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  32.69 
 
 
267 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.12 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.33 
 
 
662 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.77 
 
 
261 aa  116  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  30.37 
 
 
260 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.2 
 
 
651 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0044  short chain enoyl-CoA hydratase  35.27 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535261  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4763  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.07 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254643  normal  0.582812 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  29.37 
 
 
657 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 
257 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
261 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.29 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.37 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3188  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
262 aa  112  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.71 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5509  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5352  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.25 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.86 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.37 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.97 
 
 
259 aa  110  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  31.1 
 
 
259 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1087  enoyl-CoA hydratase  32.43 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0149  short chain enoyl-CoA hydratase  34.84 
 
 
266 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.227059  normal  0.14158 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.78 
 
 
261 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  28.63 
 
 
257 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.62 
 
 
258 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 
262 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  27.84 
 
 
258 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 
260 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  28.63 
 
 
257 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.25 
 
 
260 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.35 
 
 
258 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0429  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
262 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.297367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.73 
 
 
257 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.11 
 
 
253 aa  106  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.39 
 
 
267 aa  105  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  28.02 
 
 
257 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.31 
 
 
260 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
269 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.04 
 
 
264 aa  105  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31 
 
 
257 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4187  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 
258 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0496567  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  27.55 
 
 
258 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  28.68 
 
 
659 aa  104  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2036  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
257 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  29.8 
 
 
262 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  30.35 
 
 
663 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  27.55 
 
 
258 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2780  enoyl-CoA hydratase  30.6 
 
 
263 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  29.41 
 
 
262 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2515  enoyl-CoA hydratase  30.97 
 
 
262 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.38 
 
 
258 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  31.11 
 
 
262 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  29.63 
 
 
257 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3042  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.07 
 
 
259 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1765  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.89 
 
 
251 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1968  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.15 
 
 
258 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.503691  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.63 
 
 
257 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 
260 aa  102  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03685  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  28.19 
 
 
260 aa  102  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.675482  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2051  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.64 
 
 
260 aa  102  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0043215  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.24 
 
 
265 aa  102  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3107  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  29.62 
 
 
657 aa  102  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.25 
 
 
262 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.38 
 
 
266 aa  101  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.8 
 
 
252 aa  101  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.52 
 
 
258 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.15 
 
 
258 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577666  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  29.13 
 
 
257 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  31.52 
 
 
265 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.42 
 
 
256 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0643  short chain enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 
265 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0226779  normal  0.0998873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.14 
 
 
257 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>