147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3556 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3556  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 755 aa  1462    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  24.68 
 
 		 738 aa  100  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  25.65 
 
 		 734 aa  94.4  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  26.29 
 
 		 736 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5599  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.4 
 
 		 776 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  26.4 
 
 		 736 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  23.61 
 
 		 755 aa  78.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  24.87 
 
 		 750 aa  75.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  24.84 
 
 		 736 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  24.45 
 
 		 741 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  22.83 
 
 		 756 aa  70.1  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  23.79 
 
 		 732 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  24.13 
 
 		 740 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4497  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 		 734 aa  67.8  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.904654  normal  0.335117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3864  exopolysaccharide export associated tyrosine kinase  26.99 
 
 		 744 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  24.3 
 
 		 746 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  25.42 
 
 		 734 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  29.73 
 
 		 711 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4129  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.45 
 
 		 734 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62537 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  22.67 
 
 		 753 aa  65.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1523  non-specific protein-tyrosine kinase  32.42 
 
 		 718 aa  65.9  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4408  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.35 
 
 		 761 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  27.95 
 
 		 757 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3056  protein-tyrosine kinase  22.3 
 
 		 772 aa  62.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2644  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  20.53 
 
 		 739 aa  62.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.450164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  26.09 
 
 		 740 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  25.48 
 
 		 744 aa  62  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5849  tyrosine-protein kinase  23.38 
 
 		 748 aa  62  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  28.76 
 
 		 743 aa  62  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0820  exopolysaccharide transport protein family  26.36 
 
 		 744 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  24.4 
 
 		 727 aa  61.6  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  23.9 
 
 		 735 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0611  protein-tyrosine kinase  21.16 
 
 		 753 aa  60.8  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  26.13 
 
 		 736 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5116  exopolysaccharide transport protein family  26.24 
 
 		 755 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10723  putative EPS related membrane protein  21.15 
 
 		 796 aa  59.7  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  24.06 
 
 		 739 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  26.3 
 
 		 790 aa  59.3  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5886  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.73 
 
 		 750 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  21.51 
 
 		 790 aa  58.9  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1018  EPS I polysaccharide export transmembrane protein  24.79 
 
 		 751 aa  58.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.646097  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 		 738 aa  58.5  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0342  protein-tyrosine kinase  28.32 
 
 		 554 aa  58.2  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0461311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4310  capsular exopolysaccharide family  22.43 
 
 		 753 aa  57.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  24.17 
 
 		 739 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  23.58 
 
 		 741 aa  57.4  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  23.66 
 
 		 741 aa  57.4  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  23.66 
 
 		 741 aa  57.4  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  24.13 
 
 		 797 aa  57.4  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  24.17 
 
 		 739 aa  57.4  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  24.17 
 
 		 739 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  28.74 
 
 		 624 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.66 
 
 		 741 aa  57.4  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3844  lipopolysaccharide biosynthesis  22.13 
 
 		 740 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  23.48 
 
 		 741 aa  56.6  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  23.4 
 
 		 779 aa  55.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.75 
 
 		 720 aa  56.2  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6261  exopolysaccharide transport protein family  23.61 
 
 		 746 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  22.98 
 
 		 745 aa  55.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.14 
 
 		 741 aa  55.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  24.73 
 
 		 469 aa  55.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 731 aa  55.5  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.59 
 
 		 741 aa  55.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  21.98 
 
 		 726 aa  55.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4573  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.05 
 
 		 662 aa  55.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3552  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.83 
 
 		 764 aa  55.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.510582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  23.38 
 
 		 753 aa  54.7  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06667  hypothetical protein  22.22 
 
 		 716 aa  54.7  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  26.71 
 
 		 750 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7398  exopolysaccharide transporter  26.79 
 
 		 745 aa  53.9  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0788  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.2 
 
 		 749 aa  53.9  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3872  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.84 
 
 		 720 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332027  normal  0.0244802 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3692  lipopolysaccharide biosynthesis  26.33 
 
 		 736 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.306041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4611  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.06 
 
 		 743 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0837  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 		 759 aa  53.9  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  20.79 
 
 		 806 aa  53.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  27.79 
 
 		 733 aa  53.5  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1713  protein-tyrosine kinase  24.84 
 
 		 731 aa  53.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000917303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  28.95 
 
 		 454 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0660  exopolysaccharide transport protein family  30.77 
 
 		 776 aa  52.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491274  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1816  protein-tyrosine kinase  23.51 
 
 		 755 aa  52.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2106  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.05 
 
 		 724 aa  52.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6175  exopolysaccharide transport protein family  24.49 
 
 		 745 aa  52  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2405  lipopolysaccharide biosynthesis  22.93 
 
 		 872 aa  51.6  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.7217  normal  0.305257 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.79 
 
 		 735 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573901  normal  0.403128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  28.77 
 
 		 463 aa  51.6  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  27.87 
 
 		 472 aa  51.6  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.8 
 
 		 491 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  23.14 
 
 		 730 aa  51.2  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 		 696 aa  51.2  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  24.03 
 
 		 747 aa  50.8  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  24.47 
 
 		 755 aa  50.8  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001323  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsD exopolysaccharide synthesis  22.45 
 
 		 726 aa  50.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 730 aa  50.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.79 
 
 		 730 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3402  lipopolysaccharide biosynthesis  22.93 
 
 		 388 aa  50.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  23.75 
 
 		 734 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  26.1 
 
 		 727 aa  49.7  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  21.48 
 
 		 721 aa  49.7  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5907  exopolysaccharide transport protein family  24.14 
 
 		 745 aa  50.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459127  normal  0.402865 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>