More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02860 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02860  B12-dependent methionine synthase  100 
 
 		 355 aa  741    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  71.8 
 
 		 1226 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  69.45 
 
 		 1226 aa  529  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0442  B12-dependent methionine synthase  69.16 
 
 		 1226 aa  523  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0369  B12-dependent methionine synthase  69.46 
 
 		 1228 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.789152  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0454  B12-dependent methionine synthase  71.86 
 
 		 1228 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0341811  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  69.97 
 
 		 1227 aa  515  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03712  B12-dependent methionine synthase  70.03 
 
 		 1226 aa  513  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  70.38 
 
 		 1227 aa  512  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3951  B12-dependent methionine synthase  68.19 
 
 		 1227 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360627  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0298  B12-dependent methionine synthase  67.05 
 
 		 1230 aa  501  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0368  B12-dependent methionine synthase  66.57 
 
 		 1231 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  66.67 
 
 		 1227 aa  503  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3923  B12-dependent methionine synthase  67.05 
 
 		 1230 aa  501  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  68.7 
 
 		 1230 aa  501  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  69.85 
 
 		 1250 aa  500  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  67.89 
 
 		 1238 aa  497  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4490  B12-dependent methionine synthase  68.28 
 
 		 1209 aa  497  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.816383  normal  0.548116 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0758  B12-dependent methionine synthase  67.33 
 
 		 1246 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.659122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4523  B12-dependent methionine synthase  66.67 
 
 		 1227 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.413038 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4526  B12-dependent methionine synthase  66.67 
 
 		 1227 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4401  B12-dependent methionine synthase  66.95 
 
 		 1227 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.90979  normal  0.334358 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03891  B12-dependent methionine synthase  66.95 
 
 		 1227 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1007  B12-dependent methionine synthase  68.79 
 
 		 1244 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4563  B12-dependent methionine synthase  66.67 
 
 		 1227 aa  489  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4472  B12-dependent methionine synthase  66.67 
 
 		 1227 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.346478 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5489  B12-dependent methionine synthase  66.67 
 
 		 1227 aa  491  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4255  B12-dependent methionine synthase  66.67 
 
 		 1227 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0705471  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4599  B12-dependent methionine synthase  66.67 
 
 		 1227 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03851  hypothetical protein  66.95 
 
 		 1227 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4011  B12-dependent methionine synthase  66.67 
 
 		 1227 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.960796  normal  0.0169283 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3978  methionine synthase  66.38 
 
 		 1227 aa  486  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  68.5 
 
 		 1244 aa  485  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4435  B12-dependent methionine synthase  66.09 
 
 		 1227 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  68.21 
 
 		 1233 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  68.21 
 
 		 1244 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  68.01 
 
 		 1241 aa  485  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  66.67 
 
 		 1244 aa  487  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0995  B12-dependent methionine synthase  68.21 
 
 		 1244 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0391552  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1030  B12-dependent methionine synthase  65.92 
 
 		 1244 aa  481  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0838  B12-dependent methionine synthase  66.39 
 
 		 1244 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  66.67 
 
 		 1244 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  63.69 
 
 		 1263 aa  478  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0710  B12-dependent methionine synthase  66.57 
 
 		 1240 aa  474  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3739  B12-dependent methionine synthase  64.9 
 
 		 1252 aa  474  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  66.76 
 
 		 1237 aa  471  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  64.62 
 
 		 1232 aa  472  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4088  B12-dependent methionine synthase  68.17 
 
 		 1251 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  65.98 
 
 		 1236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  67.46 
 
 		 1238 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3384  B12-dependent methionine synthase  68.1 
 
 		 1210 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.73359  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  63.4 
 
 		 1234 aa  461  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  63.11 
 
 		 1239 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  65.1 
 
 		 1278 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  63.4 
 
 		 1234 aa  461  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2169  methionine synthase  62.25 
 
 		 1245 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.205577  normal  0.226732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2464  B12-dependent methionine synthase  62.54 
 
 		 1239 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.782684  normal  0.0191622 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0403  B12-dependent methionine synthase  62.11 
 
 		 1271 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0459446  hitchhiker  0.000026899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  63.4 
 
 		 1235 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  63.69 
 
 		 1236 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  63.11 
 
 		 1235 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  62.97 
 
 		 1232 aa  454  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  62.82 
 
 		 1235 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  63.11 
 
 		 1235 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2010  B12-dependent methionine synthase  62.57 
 
 		 1233 aa  456  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  59.66 
 
 		 1245 aa  454  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0046  B12-dependent methionine synthase  63.14 
 
 		 1220 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.61869 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  63.27 
 
 		 1237 aa  450  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  62.76 
 
 		 1232 aa  450  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0449  B12-dependent methionine synthase  62.11 
 
 		 1271 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  60.98 
 
 		 1272 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  61 
 
 		 1239 aa  444  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  59.77 
 
 		 1271 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  60.12 
 
 		 1249 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  58.33 
 
 		 1245 aa  434  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2402  homocysteine S-methyltransferase  60.41 
 
 		 353 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264872  normal  0.0639264 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  59.25 
 
 		 1228 aa  437  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1123  B12-dependent methionine synthase  61.24 
 
 		 1246 aa  434  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.833597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0892  homocysteine S-methyltransferase  62.95 
 
 		 339 aa  429  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  57.73 
 
 		 1274 aa  428  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  61.52 
 
 		 1247 aa  430  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  57.39 
 
 		 1225 aa  426  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  61.13 
 
 		 1267 aa  425  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  59.01 
 
 		 1261 aa  425  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2611  homocysteine S-methyltransferase  59.54 
 
 		 363 aa  425  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.186281 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01233  methionine synthase  59.2 
 
 		 379 aa  422  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0459633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2671  methionine synthase  58.76 
 
 		 1269 aa  424  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3545  B12-dependent methionine synthase  59.54 
 
 		 1245 aa  421  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.229259 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1692  B12-dependent methionine synthase  60.06 
 
 		 1224 aa  419  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3799  methionine synthase  56.47 
 
 		 1219 aa  419  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  56.48 
 
 		 1227 aa  418  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  58.06 
 
 		 1251 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2463  B12-dependent methionine synthase  58.84 
 
 		 1240 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  57.6 
 
 		 1243 aa  416  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4918  B12-dependent methionine synthase  60.64 
 
 		 1248 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2631  B12-dependent methionine synthase  58.36 
 
 		 1244 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0960245  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4240  methionine synthase (B12-dependent)  60.75 
 
 		 359 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.826519  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2651  B12-dependent methionine synthase  59.65 
 
 		 1257 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0388  homocysteine S-methyltransferase  60.62 
 
 		 367 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0207088 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4224  B12-dependent methionine synthase  57.02 
 
 		 1293 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>