More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01233 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01233  methionine synthase  100 
 
 		 379 aa  774    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0459633  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2611  homocysteine S-methyltransferase  83.79 
 
 		 363 aa  615  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.186281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  66.48 
 
 		 1236 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  66.76 
 
 		 1235 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  67.04 
 
 		 1235 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  65.92 
 
 		 1235 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  65.92 
 
 		 1235 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  64.86 
 
 		 1278 aa  477  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  65.63 
 
 		 1234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  65.63 
 
 		 1234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0046  B12-dependent methionine synthase  64.33 
 
 		 1220 aa  464  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.61869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  64.1 
 
 		 1236 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  62.39 
 
 		 1239 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2464  B12-dependent methionine synthase  62.11 
 
 		 1239 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.782684  normal  0.0191622 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  63.11 
 
 		 1237 aa  448  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  63.71 
 
 		 1250 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2010  B12-dependent methionine synthase  60.91 
 
 		 1233 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  61.8 
 
 		 1267 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  62.67 
 
 		 1232 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  61.8 
 
 		 1245 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  62.9 
 
 		 1245 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  62.14 
 
 		 1226 aa  444  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  62.5 
 
 		 1238 aa  442  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0758  B12-dependent methionine synthase  62.61 
 
 		 1246 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.659122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  61.14 
 
 		 1228 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  61.86 
 
 		 1233 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0298  B12-dependent methionine synthase  60.4 
 
 		 1230 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  65.04 
 
 		 1237 aa  436  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1007  B12-dependent methionine synthase  61.58 
 
 		 1244 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  61.6 
 
 		 1232 aa  436  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  61.58 
 
 		 1244 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  60.68 
 
 		 1227 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  59.89 
 
 		 1227 aa  434  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0368  B12-dependent methionine synthase  60.4 
 
 		 1231 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3923  B12-dependent methionine synthase  60.11 
 
 		 1230 aa  435  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0995  B12-dependent methionine synthase  61.58 
 
 		 1244 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0391552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  57.56 
 
 		 1272 aa  437  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  59.65 
 
 		 1263 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3951  B12-dependent methionine synthase  60.4 
 
 		 1227 aa  433  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360627  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2402  homocysteine S-methyltransferase  60.91 
 
 		 353 aa  431  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264872  normal  0.0639264 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  59.21 
 
 		 1227 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  61.03 
 
 		 1232 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1030  B12-dependent methionine synthase  59.07 
 
 		 1244 aa  431  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2169  methionine synthase  59.42 
 
 		 1245 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.205577  normal  0.226732 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0403  B12-dependent methionine synthase  56.91 
 
 		 1271 aa  429  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0459446  hitchhiker  0.000026899 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0454  B12-dependent methionine synthase  61.83 
 
 		 1228 aa  430  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0341811  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  59.89 
 
 		 1244 aa  431  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  59.6 
 
 		 1226 aa  428  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  59.89 
 
 		 1244 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  60.06 
 
 		 1220 aa  428  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  59.89 
 
 		 1244 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0369  B12-dependent methionine synthase  61.24 
 
 		 1228 aa  428  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.789152  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  60.78 
 
 		 1251 aa  428  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4401  B12-dependent methionine synthase  60.4 
 
 		 1227 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.90979  normal  0.334358 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0710  B12-dependent methionine synthase  61.74 
 
 		 1240 aa  425  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4490  B12-dependent methionine synthase  59.94 
 
 		 1209 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.816383  normal  0.548116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0838  B12-dependent methionine synthase  59.6 
 
 		 1244 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4526  B12-dependent methionine synthase  60.4 
 
 		 1227 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03712  B12-dependent methionine synthase  60.69 
 
 		 1226 aa  424  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4599  B12-dependent methionine synthase  60.4 
 
 		 1227 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4523  B12-dependent methionine synthase  60.4 
 
 		 1227 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.413038 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  58.47 
 
 		 1241 aa  422  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0449  B12-dependent methionine synthase  56.99 
 
 		 1271 aa  423  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4435  B12-dependent methionine synthase  59.83 
 
 		 1227 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0442  B12-dependent methionine synthase  58.62 
 
 		 1226 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  59.59 
 
 		 1238 aa  421  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  59.37 
 
 		 1249 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03891  B12-dependent methionine synthase  59.26 
 
 		 1227 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5489  B12-dependent methionine synthase  58.97 
 
 		 1227 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  58.11 
 
 		 1230 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2671  methionine synthase  59.24 
 
 		 1269 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0118  methionine synthase (B12-dependent)  58.38 
 
 		 351 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03851  hypothetical protein  59.26 
 
 		 1227 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  58.62 
 
 		 1236 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4011  B12-dependent methionine synthase  58.97 
 
 		 1227 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.960796  normal  0.0169283 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4472  B12-dependent methionine synthase  58.97 
 
 		 1227 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.346478 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3739  B12-dependent methionine synthase  60.06 
 
 		 1252 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0087  methionine synthase (B12-dependent)  58.81 
 
 		 355 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.398145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4255  B12-dependent methionine synthase  58.97 
 
 		 1227 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0705471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4563  B12-dependent methionine synthase  58.97 
 
 		 1227 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0156  homocysteine S-methyltransferase  56.87 
 
 		 346 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3978  methionine synthase  58.69 
 
 		 1227 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0295  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  57.37 
 
 		 346 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02860  B12-dependent methionine synthase  59.2 
 
 		 355 aa  411  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  57.59 
 
 		 1227 aa  411  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  58.02 
 
 		 1261 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0149  homocysteine S-methyltransferase  56.71 
 
 		 346 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.637039 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  56.9 
 
 		 1243 aa  411  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4224  B12-dependent methionine synthase  57.95 
 
 		 1293 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572954  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  58.43 
 
 		 1271 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2509  B12-dependent methionine synthase  58.24 
 
 		 1262 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1433  methionine synthase I, homocysteine S-methyltransferase  56.65 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.218334 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2631  B12-dependent methionine synthase  59.54 
 
 		 1244 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0960245  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0477  homocysteine S-methyltransferase  57.26 
 
 		 356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0783224 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  55.65 
 
 		 1239 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  56.04 
 
 		 1274 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4088  B12-dependent methionine synthase  59.29 
 
 		 1251 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  56.94 
 
 		 1228 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1508  homocysteine S-methyltransferase  56.29 
 
 		 334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1935  B12-dependent methionine synthase  58.4 
 
 		 1250 aa  406  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688432  normal  0.0193285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>