76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0214 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0311  integral membrane protein  50.97 
 
 
668 aa  637    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.220187  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0197  OPT family oligopeptide transporter  98.34 
 
 
664 aa  1300    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.31085  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0026  conserved hypothetical integral membrane protein, putative oligopeptide transporter, OPT family  71.43 
 
 
661 aa  934    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0236  OPT family oligopeptide transporter  98.34 
 
 
664 aa  1300    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0214  OPT family oligopeptide transporter  100 
 
 
664 aa  1320    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12980  hypothetical protein  51.03 
 
 
678 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.28182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3114  oligopeptide transporter OPT  50.45 
 
 
676 aa  609  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1173  OPT family oligopeptide transporter  50.66 
 
 
678 aa  608  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.742111  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3297  hypothetical protein  48.88 
 
 
683 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2966  OPT superfamily oligopeptide transporter  50.75 
 
 
679 aa  588  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3491  oligopeptide transporter, OPT family  48.59 
 
 
684 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.827717  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3166  oligopeptide transporter, OPT family  49.1 
 
 
684 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3263  oligopeptide transporter, OPT family  44.81 
 
 
640 aa  528  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697276  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4919  OPT family oligopeptide transporter  42.04 
 
 
669 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816736  normal  0.0168225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4609  oligopeptide transporter, OPT family  41.24 
 
 
667 aa  461  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449466  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1960  oligopeptide transporter OPT  40.9 
 
 
650 aa  454  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4197  oligopeptide transporter, OPT family  40.77 
 
 
667 aa  454  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3738  OPT family oligopeptide transporter  42.41 
 
 
662 aa  450  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2979  OPT family oligopeptide transporter  42.2 
 
 
658 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.344801 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2381  oligopeptide transporter, OPT family  41.71 
 
 
673 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0294  oligopeptide transporter, OPT family  38.1 
 
 
663 aa  411  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581981  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3808  OPT family oligopeptide transporter  41.11 
 
 
647 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.941399  normal  0.383075 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12423  integral membrane protein  39.36 
 
 
667 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00332711  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1278  OPT family oligopeptide transporter  34.6 
 
 
669 aa  386  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0768  hypothetical protein  38.18 
 
 
666 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0750  hypothetical protein  38.02 
 
 
664 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1229  oligopeptide transporter  34.6 
 
 
689 aa  386  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2688  oligopeptide transporter, OPT family  40.51 
 
 
673 aa  378  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.994806  normal  0.684458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2466  OPT family oligopeptide transporter  40.19 
 
 
688 aa  375  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.945797  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02096  oligopeptide transporter, OPT family  35.1 
 
 
656 aa  359  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.861869  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1386  OPT family oligopeptide transporter  36.32 
 
 
653 aa  348  2e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1456  oligopeptide transporter  36.17 
 
 
653 aa  348  3e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0651  OPT family oligopeptide transporter  35.17 
 
 
672 aa  341  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1090  oligopeptide transporter, OPT family  35.93 
 
 
654 aa  340  5e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1681  oligopeptide transporter, OPT family  33.18 
 
 
626 aa  281  3e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11130  oligopeptide transporter, OPT family  32.44 
 
 
636 aa  269  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1697  oligopeptide transporter, OPT family  28.79 
 
 
657 aa  258  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4203  oligopeptide transporter OPT  29.83 
 
 
675 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846925  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6444  oligopeptide transporter, OPT family  31.09 
 
 
647 aa  240  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5704  oligopeptide transporter, OPT family  28.36 
 
 
688 aa  223  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0197  oligopeptide transporter, OPT family  30.41 
 
 
683 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2650  OPT family oligopeptide transporter  29.67 
 
 
656 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0254  oligopeptide transporter, OPT family  30.18 
 
 
690 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143489  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0265  oligopeptide transporter, OPT family  30.57 
 
 
690 aa  214  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.475896  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0264  OPT family oligopeptide transporter  29.79 
 
 
706 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7216  normal  0.191897 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0243  oligopeptide transporter OPT  30.32 
 
 
690 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2707  oligopeptide transporter, OPT family  27.49 
 
 
644 aa  203  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2435  oligopeptide transporter, OPT  28.55 
 
 
664 aa  188  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.498464 
 
 
-
 
NC_002950  PG0444  OPT family oligopeptide transporter  27 
 
 
659 aa  175  2.9999999999999996e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055874 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1485  OPT family oligopeptide transporter  27.91 
 
 
638 aa  163  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1276  OPT family oligopeptide transporter  27.75 
 
 
638 aa  161  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.557964  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4609  OPT family oligopeptide transporter  27.92 
 
 
768 aa  143  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0706  oligopeptide transporters, OPT superfamily  24.8 
 
 
550 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000176165  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2274  oligopeptide transporter, OPT family  25.2 
 
 
596 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247185  normal  0.0874432 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1222  oligopeptide transporter, OPT superfamily  23.32 
 
 
622 aa  108  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.107355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3867  OPT family oligopeptide transporter  24.45 
 
 
577 aa  87.4  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1725  oligopeptide transporter, OPT superfamily  31.3 
 
 
575 aa  80.9  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2947  OPT family oligopeptide transporter  22.26 
 
 
605 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504276 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4216  oligopeptide transporters, OPT superfamily  24.27 
 
 
583 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3390  OPT family oligopeptide transporter  24.72 
 
 
585 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261384  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1819  OPT superfamily oligopeptide transporter  22.73 
 
 
540 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4241  oligopeptide transporter, OPT superfamily  24.43 
 
 
583 aa  77.4  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0353  OPT family oligopeptide transporter  22.34 
 
 
576 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0737792 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4092  OPT family oligopeptide transporter  24.78 
 
 
583 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.360567  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0332  OPT family oligopeptide transporter  23.29 
 
 
583 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00861331  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2714  oligopeptide transporters, OPT superfamily  29.27 
 
 
539 aa  70.1  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000966731  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30676  predicted protein  26.69 
 
 
722 aa  67.8  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105769  normal  0.0372054 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1179  OPT superfamily oligopeptide transporter  30.17 
 
 
581 aa  63.9  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.164863 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00700  oligopeptide transporter, OPT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13620)  28.32 
 
 
754 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2041  oligopeptide transporters, OPT superfamily  26.7 
 
 
540 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0374893  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2111  oligopeptide transporter, OPT superfamily  26.7 
 
 
540 aa  61.6  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5004  oligopeptide transporter, OPT superfamily  27.15 
 
 
611 aa  57.4  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0148  oligopeptide transporter, OPT family  35.37 
 
 
578 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02390  conserved hypothetical protein  25.15 
 
 
740 aa  55.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4611  OPT family oligopeptide transporter  25.77 
 
 
612 aa  54.7  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5795  OPT superfamily oligopeptide transporter  28 
 
 
634 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>