75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3114 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0311  integral membrane protein  56.42 
 
 		 668 aa  684    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.220187  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3297  hypothetical protein  68.09 
 
 		 683 aa  858    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3166  oligopeptide transporter, OPT family  68.99 
 
 		 684 aa  844    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12980  hypothetical protein  66.18 
 
 		 678 aa  805    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.28182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3491  oligopeptide transporter, OPT family  69.44 
 
 		 684 aa  857    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.827717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2966  OPT superfamily oligopeptide transporter  85.08 
 
 		 679 aa  1018    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3114  oligopeptide transporter OPT  100 
 
 		 676 aa  1303    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1173  OPT family oligopeptide transporter  66.47 
 
 		 678 aa  807    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.742111  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3263  oligopeptide transporter, OPT family  54.55 
 
 		 640 aa  612  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697276  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0197  OPT family oligopeptide transporter  50.45 
 
 		 664 aa  597  1e-169  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.31085  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0236  OPT family oligopeptide transporter  50.6 
 
 		 664 aa  597  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0214  OPT family oligopeptide transporter  50.45 
 
 		 664 aa  597  1e-169  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0026  conserved hypothetical integral membrane protein, putative oligopeptide transporter, OPT family  49.1 
 
 		 661 aa  568  1e-160  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4919  OPT family oligopeptide transporter  52.12 
 
 		 669 aa  560  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816736  normal  0.0168225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2979  OPT family oligopeptide transporter  50.08 
 
 		 658 aa  507  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.344801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4609  oligopeptide transporter, OPT family  46.85 
 
 		 667 aa  498  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449466  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2381  oligopeptide transporter, OPT family  49.85 
 
 		 673 aa  490  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3738  OPT family oligopeptide transporter  47.49 
 
 		 662 aa  482  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1960  oligopeptide transporter OPT  46.54 
 
 		 650 aa  480  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12423  integral membrane protein  46.62 
 
 		 667 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00332711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4197  oligopeptide transporter, OPT family  45.6 
 
 		 667 aa  467  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3808  OPT family oligopeptide transporter  50.47 
 
 		 647 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.941399  normal  0.383075 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2688  oligopeptide transporter, OPT family  49.39 
 
 		 673 aa  457  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.994806  normal  0.684458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2466  OPT family oligopeptide transporter  49.47 
 
 		 688 aa  457  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.945797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0294  oligopeptide transporter, OPT family  43.36 
 
 		 663 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581981  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1278  OPT family oligopeptide transporter  37.44 
 
 		 669 aa  403  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1229  oligopeptide transporter  37.97 
 
 		 689 aa  402  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1386  OPT family oligopeptide transporter  39.85 
 
 		 653 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1456  oligopeptide transporter  39.55 
 
 		 653 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02096  oligopeptide transporter, OPT family  40.24 
 
 		 656 aa  369  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.861869  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0768  hypothetical protein  35.36 
 
 		 666 aa  360  4e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0750  hypothetical protein  35.58 
 
 		 664 aa  359  7e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1090  oligopeptide transporter, OPT family  39.82 
 
 		 654 aa  354  2e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0651  OPT family oligopeptide transporter  37.23 
 
 		 672 aa  343  5.999999999999999e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1697  oligopeptide transporter, OPT family  31.98 
 
 		 657 aa  243  7e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1681  oligopeptide transporter, OPT family  32.11 
 
 		 626 aa  243  9e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4203  oligopeptide transporter OPT  30.32 
 
 		 675 aa  230  7e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846925  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0197  oligopeptide transporter, OPT family  29.26 
 
 		 683 aa  229  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11130  oligopeptide transporter, OPT family  33.6 
 
 		 636 aa  228  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2650  OPT family oligopeptide transporter  31.22 
 
 		 656 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6444  oligopeptide transporter, OPT family  33.86 
 
 		 647 aa  216  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2707  oligopeptide transporter, OPT family  28.06 
 
 		 644 aa  214  3.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5704  oligopeptide transporter, OPT family  29.45 
 
 		 688 aa  209  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0264  OPT family oligopeptide transporter  30.18 
 
 		 706 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7216  normal  0.191897 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0243  oligopeptide transporter OPT  29.78 
 
 		 690 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0265  oligopeptide transporter, OPT family  29.84 
 
 		 690 aa  185  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.475896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0254  oligopeptide transporter, OPT family  29.84 
 
 		 690 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143489  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0444  OPT family oligopeptide transporter  27.64 
 
 		 659 aa  169  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2435  oligopeptide transporter, OPT  29.38 
 
 		 664 aa  164  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.498464 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4609  OPT family oligopeptide transporter  29.77 
 
 		 768 aa  146  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1485  OPT family oligopeptide transporter  26.24 
 
 		 638 aa  140  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1276  OPT family oligopeptide transporter  26.09 
 
 		 638 aa  140  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.557964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0706  oligopeptide transporters, OPT superfamily  25.78 
 
 		 550 aa  127  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000176165  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1222  oligopeptide transporter, OPT superfamily  27.04 
 
 		 622 aa  108  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.107355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2274  oligopeptide transporter, OPT family  25.98 
 
 		 596 aa  107  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247185  normal  0.0874432 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2947  OPT family oligopeptide transporter  29.1 
 
 		 605 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504276 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1725  oligopeptide transporter, OPT superfamily  31.29 
 
 		 575 aa  67.8  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.268809 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00700  oligopeptide transporter, OPT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13620)  27.96 
 
 		 754 aa  67.4  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2714  oligopeptide transporters, OPT superfamily  26.79 
 
 		 539 aa  65.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000966731  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30676  predicted protein  27.37 
 
 		 722 aa  65.1  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105769  normal  0.0372054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3390  OPT family oligopeptide transporter  31.25 
 
 		 585 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261384  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2111  oligopeptide transporter, OPT superfamily  29.05 
 
 		 540 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2041  oligopeptide transporters, OPT superfamily  29.05 
 
 		 540 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0374893  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02390  conserved hypothetical protein  31.37 
 
 		 740 aa  62.4  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1179  OPT superfamily oligopeptide transporter  27.27 
 
 		 581 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.164863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0148  oligopeptide transporter, OPT family  30.57 
 
 		 578 aa  62  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4611  OPT family oligopeptide transporter  29.74 
 
 		 612 aa  61.6  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3867  OPT family oligopeptide transporter  25.82 
 
 		 577 aa  60.1  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0332  OPT family oligopeptide transporter  30.94 
 
 		 583 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00861331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4092  OPT family oligopeptide transporter  31.89 
 
 		 583 aa  57.4  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.360567  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4241  oligopeptide transporter, OPT superfamily  25.71 
 
 		 583 aa  57.4  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336098  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4216  oligopeptide transporters, OPT superfamily  28.57 
 
 		 583 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1819  OPT superfamily oligopeptide transporter  26.49 
 
 		 540 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5004  oligopeptide transporter, OPT superfamily  33.33 
 
 		 611 aa  48.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0353  OPT family oligopeptide transporter  25.5 
 
 		 576 aa  48.1  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0737792 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>