70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4203 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4203  oligopeptide transporter OPT  100 
 
 
675 aa  1318    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846925  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02096  oligopeptide transporter, OPT family  40.72 
 
 
656 aa  350  4e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.861869  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1681  oligopeptide transporter, OPT family  37.91 
 
 
626 aa  350  5e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1456  oligopeptide transporter  38.95 
 
 
653 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1386  OPT family oligopeptide transporter  38.79 
 
 
653 aa  337  3.9999999999999995e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0197  oligopeptide transporter, OPT family  34.59 
 
 
683 aa  333  6e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1090  oligopeptide transporter, OPT family  38.39 
 
 
654 aa  329  9e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1697  oligopeptide transporter, OPT family  35.99 
 
 
657 aa  326  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5704  oligopeptide transporter, OPT family  33.64 
 
 
688 aa  319  9e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11130  oligopeptide transporter, OPT family  36.03 
 
 
636 aa  317  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2650  OPT family oligopeptide transporter  34.66 
 
 
656 aa  310  6.999999999999999e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0651  OPT family oligopeptide transporter  34.95 
 
 
672 aa  302  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0265  oligopeptide transporter, OPT family  33.75 
 
 
690 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.475896  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0243  oligopeptide transporter OPT  33.75 
 
 
690 aa  300  7e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0254  oligopeptide transporter, OPT family  33.75 
 
 
690 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143489  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0264  OPT family oligopeptide transporter  33.33 
 
 
706 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7216  normal  0.191897 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2707  oligopeptide transporter, OPT family  32.63 
 
 
644 aa  276  1.0000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6444  oligopeptide transporter, OPT family  32.91 
 
 
647 aa  270  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0294  oligopeptide transporter, OPT family  34.1 
 
 
663 aa  269  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581981  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0026  conserved hypothetical integral membrane protein, putative oligopeptide transporter, OPT family  32.38 
 
 
661 aa  253  9.000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0444  OPT family oligopeptide transporter  31.83 
 
 
659 aa  248  3e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055874 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3297  hypothetical protein  32.19 
 
 
683 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0197  OPT family oligopeptide transporter  29.83 
 
 
664 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.31085  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0236  OPT family oligopeptide transporter  29.83 
 
 
664 aa  241  5e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1229  oligopeptide transporter  30.18 
 
 
689 aa  239  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0214  OPT family oligopeptide transporter  29.83 
 
 
664 aa  238  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1278  OPT family oligopeptide transporter  30.03 
 
 
669 aa  238  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3738  OPT family oligopeptide transporter  31.51 
 
 
662 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3114  oligopeptide transporter OPT  30.92 
 
 
676 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12980  hypothetical protein  31.38 
 
 
678 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.28182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4919  OPT family oligopeptide transporter  32.62 
 
 
669 aa  234  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816736  normal  0.0168225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2979  OPT family oligopeptide transporter  32.71 
 
 
658 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.344801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4609  oligopeptide transporter, OPT family  31.25 
 
 
667 aa  232  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449466  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3491  oligopeptide transporter, OPT family  32.25 
 
 
684 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.827717  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1173  OPT family oligopeptide transporter  30.59 
 
 
678 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.742111  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1960  oligopeptide transporter OPT  31.17 
 
 
650 aa  226  9e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3166  oligopeptide transporter, OPT family  32.12 
 
 
684 aa  225  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0768  hypothetical protein  27.53 
 
 
666 aa  224  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0750  hypothetical protein  27.53 
 
 
664 aa  223  6e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0311  integral membrane protein  32.22 
 
 
668 aa  222  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.220187  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12423  integral membrane protein  31.39 
 
 
667 aa  217  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00332711  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2435  oligopeptide transporter, OPT  29.48 
 
 
664 aa  217  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.498464 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4197  oligopeptide transporter, OPT family  30.84 
 
 
667 aa  216  8e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3263  oligopeptide transporter, OPT family  29.46 
 
 
640 aa  214  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697276  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2966  OPT superfamily oligopeptide transporter  31.18 
 
 
679 aa  213  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1276  OPT family oligopeptide transporter  30.89 
 
 
638 aa  211  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.557964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1485  OPT family oligopeptide transporter  30.89 
 
 
638 aa  210  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4609  OPT family oligopeptide transporter  32.74 
 
 
768 aa  208  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3808  OPT family oligopeptide transporter  31.62 
 
 
647 aa  203  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.941399  normal  0.383075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2381  oligopeptide transporter, OPT family  32.71 
 
 
673 aa  195  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2466  OPT family oligopeptide transporter  31.5 
 
 
688 aa  179  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.945797  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2688  oligopeptide transporter, OPT family  31.35 
 
 
673 aa  177  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.994806  normal  0.684458 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0706  oligopeptide transporters, OPT superfamily  27.35 
 
 
550 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000176165  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1725  oligopeptide transporter, OPT superfamily  28.89 
 
 
575 aa  139  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2274  oligopeptide transporter, OPT family  27.96 
 
 
596 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247185  normal  0.0874432 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2714  oligopeptide transporters, OPT superfamily  24.84 
 
 
539 aa  106  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000966731  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3867  OPT family oligopeptide transporter  24.14 
 
 
577 aa  88.6  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0353  OPT family oligopeptide transporter  24.27 
 
 
576 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0737792 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1222  oligopeptide transporter, OPT superfamily  23.5 
 
 
622 aa  78.2  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.107355 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1179  OPT superfamily oligopeptide transporter  24.67 
 
 
581 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.164863 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30676  predicted protein  21.67 
 
 
722 aa  66.2  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105769  normal  0.0372054 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2111  oligopeptide transporter, OPT superfamily  34.64 
 
 
540 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2041  oligopeptide transporters, OPT superfamily  34.64 
 
 
540 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0374893  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0148  oligopeptide transporter, OPT family  30.3 
 
 
578 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00700  oligopeptide transporter, OPT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13620)  21.52 
 
 
754 aa  60.1  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4611  OPT family oligopeptide transporter  22.32 
 
 
612 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3390  OPT family oligopeptide transporter  28.65 
 
 
585 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261384  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1819  OPT superfamily oligopeptide transporter  30.97 
 
 
540 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5004  oligopeptide transporter, OPT superfamily  27.96 
 
 
611 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02390  conserved hypothetical protein  26.81 
 
 
740 aa  48.9  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>