76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0148 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0148  oligopeptide transporter, OPT family  100 
 
 		 578 aa  1116    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1179  OPT superfamily oligopeptide transporter  91.36 
 
 		 581 aa  962    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.164863 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3390  OPT family oligopeptide transporter  75.34 
 
 		 585 aa  795    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261384  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0353  OPT family oligopeptide transporter  43.82 
 
 		 576 aa  445  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0737792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3867  OPT family oligopeptide transporter  42.98 
 
 		 577 aa  434  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1222  oligopeptide transporter, OPT superfamily  30.99 
 
 		 622 aa  285  2.0000000000000002e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.107355 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2947  OPT family oligopeptide transporter  36.54 
 
 		 605 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4611  OPT family oligopeptide transporter  32.24 
 
 		 612 aa  256  7e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5004  oligopeptide transporter, OPT superfamily  31.99 
 
 		 611 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0332  OPT family oligopeptide transporter  27.9 
 
 		 583 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00861331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4216  oligopeptide transporters, OPT superfamily  27.62 
 
 		 583 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4241  oligopeptide transporter, OPT superfamily  27.8 
 
 		 583 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336098  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4092  OPT family oligopeptide transporter  28.15 
 
 		 583 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.360567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1819  OPT superfamily oligopeptide transporter  30.27 
 
 		 540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2041  oligopeptide transporters, OPT superfamily  29.11 
 
 		 540 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0374893  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2111  oligopeptide transporter, OPT superfamily  29.36 
 
 		 540 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0706  oligopeptide transporters, OPT superfamily  25.21 
 
 		 550 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000176165  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2979  OPT family oligopeptide transporter  28.27 
 
 		 658 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.344801 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2274  oligopeptide transporter, OPT family  28.38 
 
 		 596 aa  97.8  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247185  normal  0.0874432 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3297  hypothetical protein  26.2 
 
 		 683 aa  97.1  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2714  oligopeptide transporters, OPT superfamily  22.77 
 
 		 539 aa  93.6  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000966731  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1681  oligopeptide transporter, OPT family  25.12 
 
 		 626 aa  90.1  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30676  predicted protein  28.57 
 
 		 722 aa  89.7  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105769  normal  0.0372054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4203  oligopeptide transporter OPT  25.19 
 
 		 675 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846925  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02390  conserved hypothetical protein  25.3 
 
 		 740 aa  83.2  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1697  oligopeptide transporter, OPT family  24.83 
 
 		 657 aa  82  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1725  oligopeptide transporter, OPT superfamily  25.37 
 
 		 575 aa  80.9  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3114  oligopeptide transporter OPT  30.57 
 
 		 676 aa  76.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4609  oligopeptide transporter, OPT family  29.3 
 
 		 667 aa  75.1  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449466  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00700  oligopeptide transporter, OPT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13620)  24.42 
 
 		 754 aa  75.1  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0026  conserved hypothetical integral membrane protein, putative oligopeptide transporter, OPT family  31.71 
 
 		 661 aa  75.1  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5704  oligopeptide transporter, OPT family  35.11 
 
 		 688 aa  74.3  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_002950  PG0444  OPT family oligopeptide transporter  23.17 
 
 		 659 aa  73.6  0.000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2435  oligopeptide transporter, OPT  23.96 
 
 		 664 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.498464 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2650  OPT family oligopeptide transporter  25.33 
 
 		 656 aa  72  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11130  oligopeptide transporter, OPT family  30.13 
 
 		 636 aa  71.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0294  oligopeptide transporter, OPT family  30.25 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581981  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3808  OPT family oligopeptide transporter  30.89 
 
 		 647 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.941399  normal  0.383075 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0197  OPT family oligopeptide transporter  30.17 
 
 		 664 aa  71.2  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.31085  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0236  OPT family oligopeptide transporter  30.17 
 
 		 664 aa  70.9  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1173  OPT family oligopeptide transporter  30.32 
 
 		 678 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.742111  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0214  OPT family oligopeptide transporter  30.17 
 
 		 664 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1960  oligopeptide transporter OPT  27.8 
 
 		 650 aa  70.1  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0651  OPT family oligopeptide transporter  30.4 
 
 		 672 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2707  oligopeptide transporter, OPT family  25.79 
 
 		 644 aa  68.9  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4609  OPT family oligopeptide transporter  36.02 
 
 		 768 aa  68.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0750  hypothetical protein  29.63 
 
 		 664 aa  67.4  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3738  OPT family oligopeptide transporter  28.51 
 
 		 662 aa  66.6  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12423  integral membrane protein  26.69 
 
 		 667 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00332711  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0768  hypothetical protein  35.26 
 
 		 666 aa  66.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2966  OPT superfamily oligopeptide transporter  29.06 
 
 		 679 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4919  OPT family oligopeptide transporter  29.21 
 
 		 669 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816736  normal  0.0168225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02096  oligopeptide transporter, OPT family  27.08 
 
 		 656 aa  64.7  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.861869  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3491  oligopeptide transporter, OPT family  26.77 
 
 		 684 aa  64.3  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.827717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3263  oligopeptide transporter, OPT family  28.99 
 
 		 640 aa  63.9  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0197  oligopeptide transporter, OPT family  27.84 
 
 		 683 aa  63.5  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1090  oligopeptide transporter, OPT family  25.74 
 
 		 654 aa  63.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0265  oligopeptide transporter, OPT family  26.02 
 
 		 690 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.475896  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1456  oligopeptide transporter  25.46 
 
 		 653 aa  63.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4197  oligopeptide transporter, OPT family  28.03 
 
 		 667 aa  62.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0264  OPT family oligopeptide transporter  28.4 
 
 		 706 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7216  normal  0.191897 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1386  OPT family oligopeptide transporter  25.46 
 
 		 653 aa  62.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0254  oligopeptide transporter, OPT family  25.34 
 
 		 690 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143489  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0243  oligopeptide transporter OPT  25.34 
 
 		 690 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1229  oligopeptide transporter  29.12 
 
 		 689 aa  61.6  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1278  OPT family oligopeptide transporter  29.12 
 
 		 669 aa  61.6  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3166  oligopeptide transporter, OPT family  28.31 
 
 		 684 aa  60.8  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0311  integral membrane protein  28.1 
 
 		 668 aa  58.9  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.220187  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1276  OPT family oligopeptide transporter  26.53 
 
 		 638 aa  57  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.557964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1485  OPT family oligopeptide transporter  26.53 
 
 		 638 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6444  oligopeptide transporter, OPT family  28.34 
 
 		 647 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2381  oligopeptide transporter, OPT family  27.49 
 
 		 673 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12980  hypothetical protein  26.04 
 
 		 678 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.28182 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5320  OPT superfamily oligopeptide transporter  25.05 
 
 		 593 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2466  OPT family oligopeptide transporter  28.14 
 
 		 688 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.945797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2688  oligopeptide transporter, OPT family  28.14 
 
 		 673 aa  47  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.994806  normal  0.684458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>