74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4609 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4609  OPT family oligopeptide transporter  100 
 
 
768 aa  1512    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11130  oligopeptide transporter, OPT family  47.82 
 
 
636 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0197  oligopeptide transporter, OPT family  45 
 
 
683 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0264  OPT family oligopeptide transporter  42.81 
 
 
706 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.7216  normal  0.191897 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0243  oligopeptide transporter OPT  43.82 
 
 
690 aa  357  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0265  oligopeptide transporter, OPT family  44 
 
 
690 aa  357  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.475896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0254  oligopeptide transporter, OPT family  43.82 
 
 
690 aa  355  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143489  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5704  oligopeptide transporter, OPT family  42.21 
 
 
688 aa  348  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6444  oligopeptide transporter, OPT family  44.57 
 
 
647 aa  333  5e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2650  OPT family oligopeptide transporter  42.38 
 
 
656 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1681  oligopeptide transporter, OPT family  43.09 
 
 
626 aa  331  4e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1697  oligopeptide transporter, OPT family  38.49 
 
 
657 aa  276  7e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2707  oligopeptide transporter, OPT family  34.95 
 
 
644 aa  257  7e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02096  oligopeptide transporter, OPT family  35.24 
 
 
656 aa  224  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.861869  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0294  oligopeptide transporter, OPT family  37.33 
 
 
663 aa  209  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.581981  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1090  oligopeptide transporter, OPT family  36.12 
 
 
654 aa  207  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2435  oligopeptide transporter, OPT  31.19 
 
 
664 aa  207  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.498464 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1456  oligopeptide transporter  36.24 
 
 
653 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1386  OPT family oligopeptide transporter  36.24 
 
 
653 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0444  OPT family oligopeptide transporter  30.74 
 
 
659 aa  202  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055874 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1485  OPT family oligopeptide transporter  30.66 
 
 
638 aa  187  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4203  oligopeptide transporter OPT  32.38 
 
 
675 aa  187  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.846925  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0750  hypothetical protein  30.75 
 
 
664 aa  186  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1276  OPT family oligopeptide transporter  30.66 
 
 
638 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.557964  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0768  hypothetical protein  30.17 
 
 
666 aa  185  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0651  OPT family oligopeptide transporter  33.86 
 
 
672 aa  182  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12980  hypothetical protein  27.96 
 
 
678 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.28182 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3166  oligopeptide transporter, OPT family  28.05 
 
 
684 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3491  oligopeptide transporter, OPT family  27.78 
 
 
684 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.827717  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3297  hypothetical protein  29.66 
 
 
683 aa  165  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1278  OPT family oligopeptide transporter  29.89 
 
 
669 aa  164  6e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0197  OPT family oligopeptide transporter  27.06 
 
 
664 aa  163  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.31085  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1229  oligopeptide transporter  29.69 
 
 
689 aa  162  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0236  OPT family oligopeptide transporter  27.34 
 
 
664 aa  162  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3114  oligopeptide transporter OPT  30.84 
 
 
676 aa  159  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1173  OPT family oligopeptide transporter  30.14 
 
 
678 aa  158  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.742111  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1960  oligopeptide transporter OPT  32.21 
 
 
650 aa  156  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2979  OPT family oligopeptide transporter  31.09 
 
 
658 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.344801 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4919  OPT family oligopeptide transporter  29.78 
 
 
669 aa  151  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.816736  normal  0.0168225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4609  oligopeptide transporter, OPT family  30.95 
 
 
667 aa  151  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449466  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0026  conserved hypothetical integral membrane protein, putative oligopeptide transporter, OPT family  28.68 
 
 
661 aa  149  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3263  oligopeptide transporter, OPT family  29.47 
 
 
640 aa  147  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697276  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2966  OPT superfamily oligopeptide transporter  30.68 
 
 
679 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3738  OPT family oligopeptide transporter  32.49 
 
 
662 aa  140  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0214  OPT family oligopeptide transporter  29.45 
 
 
664 aa  139  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3808  OPT family oligopeptide transporter  31.62 
 
 
647 aa  137  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.941399  normal  0.383075 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0311  integral membrane protein  29.42 
 
 
668 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.220187  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12423  integral membrane protein  31.31 
 
 
667 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00332711  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2381  oligopeptide transporter, OPT family  32.87 
 
 
673 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2466  OPT family oligopeptide transporter  33.4 
 
 
688 aa  120  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.945797  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2688  oligopeptide transporter, OPT family  32.73 
 
 
673 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.994806  normal  0.684458 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4197  oligopeptide transporter, OPT family  35.4 
 
 
667 aa  114  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2274  oligopeptide transporter, OPT family  27.4 
 
 
596 aa  107  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247185  normal  0.0874432 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1222  oligopeptide transporter, OPT superfamily  23.32 
 
 
622 aa  85.9  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.107355 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0706  oligopeptide transporters, OPT superfamily  25.47 
 
 
550 aa  78.2  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000176165  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00700  oligopeptide transporter, OPT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13620)  24.29 
 
 
754 aa  75.1  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1179  OPT superfamily oligopeptide transporter  35.63 
 
 
581 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.164863 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2947  OPT family oligopeptide transporter  27.78 
 
 
605 aa  72  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504276 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3390  OPT family oligopeptide transporter  37.67 
 
 
585 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261384  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0148  oligopeptide transporter, OPT family  35.47 
 
 
578 aa  70.9  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1725  oligopeptide transporter, OPT superfamily  30.6 
 
 
575 aa  67.4  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.116386  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0353  OPT family oligopeptide transporter  24.4 
 
 
576 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0737792 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4241  oligopeptide transporter, OPT superfamily  25.51 
 
 
583 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00336098  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2714  oligopeptide transporters, OPT superfamily  29.39 
 
 
539 aa  66.6  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000966731  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3867  OPT family oligopeptide transporter  28.32 
 
 
577 aa  65.5  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4216  oligopeptide transporters, OPT superfamily  25.51 
 
 
583 aa  65.1  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0332  OPT family oligopeptide transporter  26.02 
 
 
583 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00861331  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02390  conserved hypothetical protein  29.38 
 
 
740 aa  57.4  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30676  predicted protein  27.59 
 
 
722 aa  56.2  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105769  normal  0.0372054 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4092  OPT family oligopeptide transporter  24.45 
 
 
583 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.360567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1819  OPT superfamily oligopeptide transporter  24.38 
 
 
540 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5004  oligopeptide transporter, OPT superfamily  35 
 
 
611 aa  51.6  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2111  oligopeptide transporter, OPT superfamily  26.25 
 
 
540 aa  49.3  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2041  oligopeptide transporters, OPT superfamily  27.17 
 
 
540 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0374893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>